学科排名
截至2011年03月，教育部学科测评中，厦门大学共15个学科进入全国参评院校前十名：分别是化学、工商管理、理论经济学、应用经济学、法学、社会学、民族学、教育学、新闻传播学、艺术学、历史学、海洋科学、生物学、航空宇航科学与技术、环境科学与工程。其中，海洋科学排名第2，应用经济学排名第3，民族学排名第4。
一级学科国家重点学科名单
| 学科门类 | 一级学科代码 | 一级学科 |
| 经济学 | 0201 | 理论经济学 |
| 0202 | 应用经济学 | |
| 理学 | 0703 | 化学 |
| 0707 | 海洋科学 | |
| 管理学 | 1202 | 工商管理引 |
二级学科国家重点学科名单
| 学科门类 | 所属一级学科 | 专业代码 | 学科、专业名称 |
| 法学 | 法学 | 030109 | 国际法学 |
| 教育学 | 教育学 | 040106 | 高等教育学 |
| 历史学 | 历史学 | 060105 | 专门史 |
| 理学 | 数学 | 070101 | 基础数学 |
| 物理学 | 070205 | 凝聚态物理 | |
| 生物学 | 071002 | 动物学 | |
| 生物学 | 071004 | 水生生物学 | |
| 生物学 | 071009 | 细胞生物学 | |
| 工学 | 环境科学与工程 | 083001 | 环境科学引 |
