四川农业大学兽医学科办学历史悠久，创办于1912年的畜牧兽医组，历经兽医系、畜牧兽医系等不同发展阶段，1994年纳入动物科技学院，2007年纳入独立组建成立的动物医学院。兽医学学科1981年成为硕士学位授权学科；预防兽医学学科于2000年成为博士学位授权学科；2005年获兽医学一级学科博士学位授权，2007年成为博士后科研流动站，2007年批准为重点（培育）学科；自“九五”起一直是国家“211工程”重点建设学科。

兽医学科现有教师和教学辅助人员 74人，其中，教授21人，副教授 20人；有新世纪国家“百千万人才工程”国家级人选1人、教育部新世纪优秀人才支持计划2人、四川省学术和技术带头人6人、四川省学术和技术带头人后备人选16人、四川省有突出贡献的优秀专家5人、享受国务院政府特殊津贴专家5人；有博士生导师14人、硕士生导师38人；有国家级教学团队-动物预防医学教学团队（2008）1个、国家级科研创新团队-教育部长江学者和创新团队（2009）1个；有一级学科博士点 1 个、二级学科博士点 3 个、博士后流动站 1 个、二级学科硕士点 7 个。

学科以四川省重点学科（1996）、四川省“重中之重”学科（2004）、国家重点培育学科（2007），有动物医学生物技术中心重点实验室（1995）动物疫病与人类健康四川省重点实验室（2004）、国家林业局国家级陆生野生动物疫源疫病监测（2005）、农业部水产用兽药临床药效及残留试验单位（ 2007）、动物疾病与环境公害四川省重点实验室（2008）、农业部“兽用药物与兽医生物技术”四川科学实验观测站（2011）等科技平台为支撑，在动物重大疫病病原功能基因的发掘、改造与利用，禽类重要疾病的发病机理及防控，西南珍稀动物疾病监控与保护，危害淡水养鱼重大疫病病原学及其致病机制等研究方向具有优势。经过长期的积累和发展，学科整体实力明显提高，已经逐步形成为特色鲜明、区域优势明显、整体实力位居国内同类学科的先进行列、西南地区相同学科中最强的学科。

近年来，学科承担国家和省部级重大研究课题100余项，发表SCI/EI论文100余篇，出版专著20余部，“禽传染性支气管炎（新变型）综合防治”获四川省科技进步一等奖（2000）、“伪狂犬病病毒分子生物学及基因缺失疫苗株的研究”获四川省科技进步二等奖（2001）、猪伪狂犬病活疫苗获得国家新兽药证书（2003）、“猪鸡耐药谱调查及针对性新药研究”获四川省科技进步一等奖（2004）、猪伪狂犬病基因缺失疫苗株（SA215）的研究和应用”获国家科技进步二等奖（2005）、规模化养鸭主要传染病防治关键技术的研究和应用获四川省科技进步二等奖（2005）、荥经长毛兔选育及配套技术研究获四川省科技进步一等奖（2006）、畜禽疫病防控体系无公害系列药品开发及产业化示范获四川省科技进步一等奖（2007）、植物源印楝油避孕制剂获得国家专利（2007）、鸭传染性浆膜炎灭活疫苗获得国家新兽药注册证书（2009），一种检测犬恶丝虫的斑点酶联免疫试剂盒获得国家新型实用专利（2009）。

学科拥有实验仪器750余件，万元以上300件，总值3000余万元。目前，兽医学科正在建设生物安全二级实验室（P2+）、SPF实验动物屏障系统和洁净细胞培养室，该工程的完成将推动我校兽医学科上新台阶。