林木遗传育种学专业2006年被批准为硕士学位授权学科，于2007年开始招收硕士研究生。现有专职教师7人，其中博士生导师1人，硕士生导师3人。主要研究方向有森林植物种质资源开发与利用、生物技术在林业中的应用、林木育种（含经济林）等。近年来，主研部、省级课题4项，获得国家发明专利2项，10个林木、竹类良种通过省级认定，其中自主育成的两个核桃早实新品种在四川山区农、林业产业结构调整中发挥了重要作用，同时在木本植物组织培养及工厂化育苗、珍稀濒危植物和特用经济林木种质资源的开发利用等方面取得了明显成效。