一、考试大纲的性质
分子生物学虽然是新生学科，但却是其他学科如细胞学、遗传学、生理学、解剖学的基础。因此在重点考察分子生物学的基础知识同时，与其他学科的交叉、联系也需要掌握。特编写此考试大纲作为参考，使考生更能把握考试的范围和要求。
二、考试内容
（一）细胞与生物大分子
1．细胞类型：掌握原核生物（真细菌、古细菌）、真核生物的基本特征；细胞分化的概念及基因内涵。
2．细胞器：核、线粒体、内质网、微体、核糖体、叶绿体的结构与组成特征；其主要的分子生物学功能。
3．生物大分子：了解蛋白质、核酸的结构、组成、性质与功能；不同多糖的组成与结构特征；脂类的基本类型与功能；复合分子：糖蛋白、脂蛋白的结构特点、分布、功能。
4．大分子聚合物：细胞骨架、核糖体、质膜的分子结构、功能。
（二、）蛋白质结构
1．氨基酸：种类；物理、化学性质；含带电侧链氨基酸的带电性质；极性非带电氨基酸、非极性氨基酸、芳香族氨基酸结构、特点。
2．白质结构与功能：大小与形状；一级结构、二级结构、三级结构及四级结构；不同种类蛋白质所执行的功能；结构功能域、族。
3．蛋白质分析：利用蛋白质不同性质组合不同纯化方法；蛋白质超量表达与纯化；蛋白质序列分析方法、cDNA序列推测蛋白质序列；蛋白质分子量确定；蛋白质结构的X光晶体衍射和核磁共振分析。
（三）核酸结构与性质
1．结构：碱基、核苷酸、磷酸二酯键；核酸序列；DNA双螺旋结构；RNA二级结构；核酸的修饰
2．核酸的物理化学性质：稳定性机制；酸、碱稳定性；化学变性；粘度和浮力密度及上述性质的应用。
3．光谱和温度性质：紫外吸收、减色现象；核酸的定量；DNA纯度；热变性和复性。
4．DNA折叠：封闭环状DNA；超螺旋；拓扑结构；与溴化乙锭结合特性；拓扑异构酶。
（四）原核生物染色体结构
1. 大肠杆菌染色体结构；DNA结构功能域；基因组的折叠；DNA结合蛋白。
2．真核生物的染色质结构：染色质、组蛋白、核小体、H1蛋白功能；30 nm纤维结构及高级结构；分裂期染色体、着丝点、端粒；DNase I 酶切超敏感区。
3．非编码DNA：结构、组成及性质；基因组复性动力学；单一序列基因；重复基因簇；重复序列；卫星DNA。
（五）DNA复制
1．半保留复制的机制；复制子、起始复制点和终点；半保留不连续复制；RNA引物。
2．细菌DNA复制：起始、解旋、延长、中止及分离。
3．真核生物DNA复制：细胞周期概念；复制起点和复制起始、复制叉、核基质、核纤层、线性DNA 末端复制（端粒与端粒酶）。
（六）、DNA损伤、修复和重组
1．NA诱变：突变的概念；复制忠实性；物理、化学诱变；突变修复与突变的固定。
2．DNA损伤：DNA损伤各种诱因。
3．DNA修复：光修复酶（Photolyases）、烷基转移酶作用机制；碱基切除修复、碱基错配修复、SOS系统。
4．重组：同源重组、专一位点重组、转座子。
（七）基因操作
1．DNA克隆：DNA克隆概念；寄主、载体；亚克隆、DNA文库、文库筛选、克隆的鉴定
2．质粒DNA的制备：质粒载体、制备、碱裂解、酚抽提、乙醇沉淀、氯化铯密度梯度离心。
3．限制性内切酶及电泳：识别位点、粘性末端、限制性降解、琼脂糖电泳、片断回收。
4．连接、转化及重组子分析：DNA连接、DNA分子重组；碱性磷酸酶及其作用；转化、筛选重组子，重组DNA的酶切鉴定。
（八）克隆载体
1．质粒载体的设计：双抗性、蓝白筛选；多克隆位点、克隆基因的转录；表达载体。
2．粘粒及：大片断DNA的克隆；粘粒载体；细菌人工染色体，酵母人工染色体载体，人类人工染色体。
3．真核载体：农杆菌Ti质粒；穿梭质粒；DNA直接转化。
（九）基因文库
1．基因组文库：文库的完整性；文库大小；基因组DNA制备、载体选择。
2．cDNA文库：mRNA分离、纯化及大小分部；cDNA合成；cDNA末端的处理；与载体的连接。
3．文库筛选步骤：菌落、噬菌斑的杂交；表达文库的筛选；染色体行走。
（十）克隆基因的分析和利用
1．克隆鉴定的主要内容；限制性图谱分析；制备探针；Southern杂交。
2．核酸序列分析：分析方法的原理；核酸序列数据库；序列的各种分析；基因组全序列分析。
3．PCR分析：PCR反应原理；模板DNA制备、引物设计、聚合酶性质；PCR反应优化。
4．克隆基因的鉴定：cDNA在基因组上的定位；S1酶作图；引物延伸试验（Primer extension）、胶滞留试验（Gel retardation）、DNase I足印迹；报告基因的应用。
5．克隆基因的修饰：缺失、点突变、PCR诱变。
6．克隆应用：改造蛋白质；基因修饰生物；DNA指纹分析；医学诊断；基因治疗。
（十一）原核生物的基因转录
1．转录的基本原理：基本概念；转录起始、转录延长、转录中止基本过程。
2．大肠杆菌RNA聚合酶：组成、各部分的可能功能。
3．大肠杆菌σ70启动子：启动子序列；启动子大小；－10区、－35区结构与功能；转录起始点；启动子活性及影响因素。
4．转录起始、转录延长、转录中止：结合启动子；DNA解旋；RNA链的起始、延长、终止涉及的序列、酶、蛋白质因子等。
（十二）原核生物转录的调控
1．Lac操纵子：操纵子概念、乳糖操纵子；阻遏物及其结合位点；诱导概念、诱导物的特点；cAMP受体蛋白。
2．色氨酸（Trp）操纵子：色氨酸阻遏物；弱化子；前导RNA结构；前导肽；弱化现象及其重要性。
3．利用其他σ因子调节转录：热激蛋白基因表达、芽孢形成及噬菌体相关σ因子调节。
（十三）真核生物的基因转录
1．三种RNA的特性及功能：真核生物RNA聚合酶分类；RNA聚合酶亚基；RNA聚合酶活性。
2．RNA聚合酶I转录基因－rRNA基因：聚合酶I特点；rRNA基因；RNA聚合酶I启动子结构及上游序列结合因子；选择性因子1的功能；TBP及TAFIs。
3．RNA聚合酶III转录基因－5S及tRNA转录：RNA聚合酶III特点；tRNA基因；5S RNA基因；RNA聚合酶III的转录终止。
4．RNA聚合酶II转录基因－启动子及增强子：RNA聚合酶II特点；启动子特点；上游调节序列；增强子概念及特性。
5．通用转录因子及RNA聚合酶II的起始：RNA聚合酶II基本转录因子；TFIID、TBP、TFIIA、TFIIB、TFIIE、TFIIF、TFIIH、TFIIJ等因子及作用。
（十四）真核生物的转录调节
1．DNA结合结构域：HLH，HTH结构域、Zn指结构域结构特点，亮氨酸拉链；二聚体结构域；转录激活结构域；抑制子结构域；转录调节。
2．顺式作用元件与反式作用因子（应答元件与转录因子）
3．转录调节的实例：组成型转录调节因子SP1；植物激素调节；光对转录的调节；金属硫蛋白的表达调控。
（十五）RNA加工与RNA－蛋白质复合物（RNPs）
1．rRNA加工与核糖体：加工类型；原核生物的rRNA加工；真核生物的rRNA加工；RNPs概念；原核、真核核糖体的结构。
2．tRNA加工、Rnase P及核酶（Ribozymes）：原核、真核tRNA加工；Rnase P结构与功能；核酶结构特点与功能。
3．mRNA加工、hnRNPs及snRNPs：mRNA加工概念与过程；hnRNPs结构与功能；snRNPs结构与功能。
4．mRNA另类加工：Poly（A）位点改变、可变剪切、RNA编辑等概念及意义。
（十六）遗传密码及tRNA
1．遗传密码：遗传密码构成、破译、特点；碱基突变与密码改变；密码通用性；阅读框架（ORFs）；重叠基因及意义。
2．tRNA结构与功能：tRNA一级、二级、三级结构；tRNA功能；氨基酰tRNA及其合成酶；忠实读码（Proofreading）概念。
（十七）蛋白质合成
1．蛋白质合成有关因素：密码子与反义密码子及“摇摆假设”（Wobble hypothesis）；核糖体结合位点；多核糖体概念；起始tRNA。
2．蛋白质合成机制：大体过程；真核、原核生物蛋白质起始、延长、终止的具体过程及涉及的主要酶、因子等。
3．翻译调节核转录后加工、运输、修饰、降解等。
（十八）植物基因工程
1．目的基因的分离和鉴定。
2．植物表达载体的构建。
3．植物基因转化的原理与方法。
4．转化细胞的筛选与转基因植物的鉴定。
5．植物基因工程的应用。
三、考试要求
考生应系统掌握该课程的基本概念，注意各部分内容关系。对一些关键技术要求掌握其原理和主要步骤。在对课程融会贯通基础上，能够对一些综合性的问题进行分析并提出解决方案。
四、试卷结构
基础知识占40％，综合、分析题占40％，创造性思维题占20％。试卷主要由名词解释、填空题、简答题、综合分析题等组成。
五、考试方式和时间限制
考试方式为笔试，时间三小时。
六、参考教材
P C Turner，A G McLennan，A D Bates & M R H White,1999,《分子生物学》(Instant Notes in Molecular Biology) (影印版)，科学技术出版社。
朱玉贤，李毅，1997，《现代分子生物学》，高等教育出版社。
分子生物学虽然是新生学科，但却是其他学科如细胞学、遗传学、生理学、解剖学的基础。因此在重点考察分子生物学的基础知识同时，与其他学科的交叉、联系也需要掌握。特编写此考试大纲作为参考，使考生更能把握考试的范围和要求。
二、考试内容
（一）细胞与生物大分子
1．细胞类型：掌握原核生物（真细菌、古细菌）、真核生物的基本特征；细胞分化的概念及基因内涵。
2．细胞器：核、线粒体、内质网、微体、核糖体、叶绿体的结构与组成特征；其主要的分子生物学功能。
3．生物大分子：了解蛋白质、核酸的结构、组成、性质与功能；不同多糖的组成与结构特征；脂类的基本类型与功能；复合分子：糖蛋白、脂蛋白的结构特点、分布、功能。
4．大分子聚合物：细胞骨架、核糖体、质膜的分子结构、功能。
（二、）蛋白质结构
1．氨基酸：种类；物理、化学性质；含带电侧链氨基酸的带电性质；极性非带电氨基酸、非极性氨基酸、芳香族氨基酸结构、特点。
2．白质结构与功能：大小与形状；一级结构、二级结构、三级结构及四级结构；不同种类蛋白质所执行的功能；结构功能域、族。
3．蛋白质分析：利用蛋白质不同性质组合不同纯化方法；蛋白质超量表达与纯化；蛋白质序列分析方法、cDNA序列推测蛋白质序列；蛋白质分子量确定；蛋白质结构的X光晶体衍射和核磁共振分析。
（三）核酸结构与性质
1．结构：碱基、核苷酸、磷酸二酯键；核酸序列；DNA双螺旋结构；RNA二级结构；核酸的修饰
2．核酸的物理化学性质：稳定性机制；酸、碱稳定性；化学变性；粘度和浮力密度及上述性质的应用。
3．光谱和温度性质：紫外吸收、减色现象；核酸的定量；DNA纯度；热变性和复性。
4．DNA折叠：封闭环状DNA；超螺旋；拓扑结构；与溴化乙锭结合特性；拓扑异构酶。
（四）原核生物染色体结构
1. 大肠杆菌染色体结构；DNA结构功能域；基因组的折叠；DNA结合蛋白。
2．真核生物的染色质结构：染色质、组蛋白、核小体、H1蛋白功能；30 nm纤维结构及高级结构；分裂期染色体、着丝点、端粒；DNase I 酶切超敏感区。
3．非编码DNA：结构、组成及性质；基因组复性动力学；单一序列基因；重复基因簇；重复序列；卫星DNA。
（五）DNA复制
1．半保留复制的机制；复制子、起始复制点和终点；半保留不连续复制；RNA引物。
2．细菌DNA复制：起始、解旋、延长、中止及分离。
3．真核生物DNA复制：细胞周期概念；复制起点和复制起始、复制叉、核基质、核纤层、线性DNA 末端复制（端粒与端粒酶）。
（六）、DNA损伤、修复和重组
1．NA诱变：突变的概念；复制忠实性；物理、化学诱变；突变修复与突变的固定。
2．DNA损伤：DNA损伤各种诱因。
3．DNA修复：光修复酶（Photolyases）、烷基转移酶作用机制；碱基切除修复、碱基错配修复、SOS系统。
4．重组：同源重组、专一位点重组、转座子。
（七）基因操作
1．DNA克隆：DNA克隆概念；寄主、载体；亚克隆、DNA文库、文库筛选、克隆的鉴定
2．质粒DNA的制备：质粒载体、制备、碱裂解、酚抽提、乙醇沉淀、氯化铯密度梯度离心。
3．限制性内切酶及电泳：识别位点、粘性末端、限制性降解、琼脂糖电泳、片断回收。
4．连接、转化及重组子分析：DNA连接、DNA分子重组；碱性磷酸酶及其作用；转化、筛选重组子，重组DNA的酶切鉴定。
（八）克隆载体
1．质粒载体的设计：双抗性、蓝白筛选；多克隆位点、克隆基因的转录；表达载体。
2．粘粒及：大片断DNA的克隆；粘粒载体；细菌人工染色体，酵母人工染色体载体，人类人工染色体。
3．真核载体：农杆菌Ti质粒；穿梭质粒；DNA直接转化。
（九）基因文库
1．基因组文库：文库的完整性；文库大小；基因组DNA制备、载体选择。
2．cDNA文库：mRNA分离、纯化及大小分部；cDNA合成；cDNA末端的处理；与载体的连接。
3．文库筛选步骤：菌落、噬菌斑的杂交；表达文库的筛选；染色体行走。
（十）克隆基因的分析和利用
1．克隆鉴定的主要内容；限制性图谱分析；制备探针；Southern杂交。
2．核酸序列分析：分析方法的原理；核酸序列数据库；序列的各种分析；基因组全序列分析。
3．PCR分析：PCR反应原理；模板DNA制备、引物设计、聚合酶性质；PCR反应优化。
4．克隆基因的鉴定：cDNA在基因组上的定位；S1酶作图；引物延伸试验（Primer extension）、胶滞留试验（Gel retardation）、DNase I足印迹；报告基因的应用。
5．克隆基因的修饰：缺失、点突变、PCR诱变。
6．克隆应用：改造蛋白质；基因修饰生物；DNA指纹分析；医学诊断；基因治疗。
（十一）原核生物的基因转录
1．转录的基本原理：基本概念；转录起始、转录延长、转录中止基本过程。
2．大肠杆菌RNA聚合酶：组成、各部分的可能功能。
3．大肠杆菌σ70启动子：启动子序列；启动子大小；－10区、－35区结构与功能；转录起始点；启动子活性及影响因素。
4．转录起始、转录延长、转录中止：结合启动子；DNA解旋；RNA链的起始、延长、终止涉及的序列、酶、蛋白质因子等。
（十二）原核生物转录的调控
1．Lac操纵子：操纵子概念、乳糖操纵子；阻遏物及其结合位点；诱导概念、诱导物的特点；cAMP受体蛋白。
2．色氨酸（Trp）操纵子：色氨酸阻遏物；弱化子；前导RNA结构；前导肽；弱化现象及其重要性。
3．利用其他σ因子调节转录：热激蛋白基因表达、芽孢形成及噬菌体相关σ因子调节。
（十三）真核生物的基因转录
1．三种RNA的特性及功能：真核生物RNA聚合酶分类；RNA聚合酶亚基；RNA聚合酶活性。
2．RNA聚合酶I转录基因－rRNA基因：聚合酶I特点；rRNA基因；RNA聚合酶I启动子结构及上游序列结合因子；选择性因子1的功能；TBP及TAFIs。
3．RNA聚合酶III转录基因－5S及tRNA转录：RNA聚合酶III特点；tRNA基因；5S RNA基因；RNA聚合酶III的转录终止。
4．RNA聚合酶II转录基因－启动子及增强子：RNA聚合酶II特点；启动子特点；上游调节序列；增强子概念及特性。
5．通用转录因子及RNA聚合酶II的起始：RNA聚合酶II基本转录因子；TFIID、TBP、TFIIA、TFIIB、TFIIE、TFIIF、TFIIH、TFIIJ等因子及作用。
（十四）真核生物的转录调节
1．DNA结合结构域：HLH，HTH结构域、Zn指结构域结构特点，亮氨酸拉链；二聚体结构域；转录激活结构域；抑制子结构域；转录调节。
2．顺式作用元件与反式作用因子（应答元件与转录因子）
3．转录调节的实例：组成型转录调节因子SP1；植物激素调节；光对转录的调节；金属硫蛋白的表达调控。
（十五）RNA加工与RNA－蛋白质复合物（RNPs）
1．rRNA加工与核糖体：加工类型；原核生物的rRNA加工；真核生物的rRNA加工；RNPs概念；原核、真核核糖体的结构。
2．tRNA加工、Rnase P及核酶（Ribozymes）：原核、真核tRNA加工；Rnase P结构与功能；核酶结构特点与功能。
3．mRNA加工、hnRNPs及snRNPs：mRNA加工概念与过程；hnRNPs结构与功能；snRNPs结构与功能。
4．mRNA另类加工：Poly（A）位点改变、可变剪切、RNA编辑等概念及意义。
（十六）遗传密码及tRNA
1．遗传密码：遗传密码构成、破译、特点；碱基突变与密码改变；密码通用性；阅读框架（ORFs）；重叠基因及意义。
2．tRNA结构与功能：tRNA一级、二级、三级结构；tRNA功能；氨基酰tRNA及其合成酶；忠实读码（Proofreading）概念。
（十七）蛋白质合成
1．蛋白质合成有关因素：密码子与反义密码子及“摇摆假设”（Wobble hypothesis）；核糖体结合位点；多核糖体概念；起始tRNA。
2．蛋白质合成机制：大体过程；真核、原核生物蛋白质起始、延长、终止的具体过程及涉及的主要酶、因子等。
3．翻译调节核转录后加工、运输、修饰、降解等。
（十八）植物基因工程
1．目的基因的分离和鉴定。
2．植物表达载体的构建。
3．植物基因转化的原理与方法。
4．转化细胞的筛选与转基因植物的鉴定。
5．植物基因工程的应用。
三、考试要求
考生应系统掌握该课程的基本概念，注意各部分内容关系。对一些关键技术要求掌握其原理和主要步骤。在对课程融会贯通基础上，能够对一些综合性的问题进行分析并提出解决方案。
四、试卷结构
基础知识占40％，综合、分析题占40％，创造性思维题占20％。试卷主要由名词解释、填空题、简答题、综合分析题等组成。
五、考试方式和时间限制
考试方式为笔试，时间三小时。
六、参考教材
P C Turner，A G McLennan，A D Bates & M R H White,1999,《分子生物学》(Instant Notes in Molecular Biology) (影印版)，科学技术出版社。
朱玉贤，李毅，1997，《现代分子生物学》，高等教育出版社。