湖南大学生物化学真题答题(大题,须稍加整理)

本站小编 免费考研网/2016-01-10

DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变性解链成单链,在DNA聚合酶与启动子的参与下,根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子挎贝。在 聚合酶链式反应实验中发现,DNA在高温时也可以发生变性解链,当温度降低后又可以复性成为双链。因此,通过温度变化控制DNA的变性和复性,并设计引物做启动子,加入DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。
PCR利用了DNA的热变性原理,通过控制温度来控制双链的解聚与结合,现在使用的PCR仪实质上也是一台能够自动调控温度的仪器。
PCR一般经历三十多次循环,每次循环可以分为三个基本步骤──变性、复性和延伸。
(!)变性(模板DNA解旋)
模板DNA经加热至90℃以上。一定时间后,使模板DNA双链解离,使成为单链,以便于它与引物结合,为下轮反应作准备。
(2)复性(退火)
模板DNA经加热变性成单链后,温度降到50℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合。
(3)延伸
DNA模板-引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下以脱氧核苷酸为原料,以母链为模板,按碱基互补配对的原则与半保留复制的原理,合成一条新的DNA链。
循环数    变性    复性    延伸
第一次(预变性)    94°C,30s    -    -
30次    94℃,20s    52℃,20s    72℃,20s
最后一次(保温)            72℃,30s
(2)琼脂糖凝胶电泳
DNA在电厂作用下,可以由电源的负极向正极泳动,泳动的速度与DNA片段的长度成负相关,与电压强度成正比,因此可以分离不同长度的DNA。在有DNA marker(不同已知碱基对大小的DNA片段的混合物)的条件下,由于不同碱基大小的DNA片段在琼脂糖凝胶上涌动的速度不同,因此电泳完毕后会出现在胶块的不同位置。通过将扩增出的DNA片段与已知的条带做比较,可以大概推测出该片段的碱基对的大小。如果要进一步检测其大小,可以换另外规格的DNA marker 继续电泳。核酸荧光染料可以与DNA嵌合,一起电泳,DNA图谱观察仪可以激发特定的蓝色光源,荧光染料在该光照射下可见到荧光,荧光的亮度与DNA大小成正比。
三、实验仪器及试剂
7种PCR组分 微量可调移液器 离心管 PCR仪 水平电泳槽 电泳仪电源 紫外分光光度计 250ml锥形瓶(封口膜) 记号笔 卫生纸
四、实验步骤
1、DNA体外扩增
(1) 将所有试剂管瞬时离心一次(4000r/min,1min),使管壁没有残留药品,在引物I 和引物II的离心管内用移液器各加入40ul双蒸水(ddH2O),混匀后瞬时离心一次。所有的离心管都摆到双面板上。
(2)向装有Taq DNA 聚合酶的离心管按下表加入以下成分:
10x Buffer    50 μL
MgCl2    50 μL
dNTP mixture    20μL
上游引物(引物I)
25μL
下游引物(引物II)
25 μL
模板DNA    25 μL
ddH2O    290μL
原有的Taq DNA 聚合酶有15ul,此时混合液体系共计500ul,此步骤由第一、二组同学合作完成。(在实验老师的监督指导下操作,确保此后其他同学的实验顺利进行)
(3)共分25组,第一、二组的同学并入其他小组进行实验。每组取20ul的上述混合液于0.5ml的离心管中,加入15ul的液体石蜡封闭体系,以防止在加热过程中蒸发。
(4) 对自己组的离心管上进行标记之后,放到PCR仪上进行DNA扩增。
2、琼脂糖凝胶电泳检测DNA
(1)用蒸馏水将电泳槽和梳子冲洗干净,放在水平桌面上,并架好梳子。
(2)配制浓度为1%(1 g/100 mL)的琼脂糖凝胶2块。在锥形瓶中,称取1g的琼脂糖粉,加入100ml 1x电泳缓冲液,用封口膜封住瓶口后在微波炉内加热,使琼脂糖粉熔化,然后冷却至60 ℃,倒入电泳槽中(每块胶50ml),插好梳子,待其凝固。(电泳槽首先用透明胶带将两端封住再进行倒胶)
(3)待胶凝固后,去掉胶带纸,小心移去梳子,注意不要破坏加样孔。将倒胶槽至于水平电泳槽内,梳井(点样孔)一端朝负极方向。向电泳槽中缓缓倒入1x电泳缓冲液,以没过胶面2 mm为宜。
(5)将80ul的6xLoading Buffer 加入到80ul的核酸荧光染料中,按1:1比例混合。
(6)移液器枪头插入到扩增出的样品离心管的底部,吸取20ul样品于另一0.5ml的离心管中,注意不要吸到液体石蜡,再加1ul的染料混合液,充分振荡混匀。用移液器吸取10ul缓慢加入梳井内,枪头抵到梳井口,以防止样液被缓冲液冲散,此外,为防止手抖将凝胶破坏,可以用左手扶住右手的手腕。
(6)盖上电泳槽盖,接通电源,电压为80 V,电流最大。
(7)当指示剂移动到凝胶中间时,断开电源,终止电泳。
(8)取出凝胶块,在DNA图谱观察仪中观察电泳带及其位置,判断扩增产物的情况。
3、紫外分光光度计检测DNA含量
(1)最后1组取2ulPCR反应液,加入98ul蒸馏水,将样品稀释50倍。
(2)以蒸馏水作为空白对照,在波长260nm处,将紫外分光光度计的读数调节至零。
(3)加入DNA稀释液100ul至比色杯中,测定260nm处的光吸收值。
(4)根据下面的公式计算DNA含量:
DNA含量(ul/ml)=50*(260nm的读数)x稀释倍数
       五、注意事项
    1 离心机上盖没有锁,在离心机运转时,转速最高可达16000r/min,如果这时打开离心机上盖,里面的离心管就会甩出,对人身造成危险,切忌等全部停下来之后再打开上盖取出离心管。另外,离心管一定要对称放置。
    2 水平电泳槽在电泳时一定要盖上上盖,此时的缓冲液电压可以达到80V,大大超过了人体的安全电压,切忌不能用手触碰缓冲液或者是电源两端接头。
            简答题
    1. 氨基酸脱氨后产生的氨和α-酮酸有哪些主要的去路?


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