导师姓名：Henning Hermjakob
性别：
人气指数：155

所属院校：重庆邮电大学
所属院系：
职称：
导师类型：
招生专业：


个人简述 :
国家蛋白质科学中心（北京）生物信息部部长 （蛋白质组学国家重点实验室）；英国剑桥欧洲生物信息研究所（EMBL-EBI）分子系统部部长（欧洲分子生物实验室）。Henning Hermjakob在欧洲生物信息学研究所所带领的分子系统小组，为系统生物学的研究提供了广泛的资源，包括从蛋白质表达（PRIDE），分子间相互作用（IntAc）和反应途径（Reactome）到系统生物学模型（BioModels）。作为HUPO蛋白质组学标准计划的共同主席和创始成员，英国蛋白质组学研究协会执行委员会成员（BSPR），蛋白质组学杂志的资深编辑,Henning Hermjakob 致力于蛋白组学和系统生物学数据标准化的研究。在凤凰中心，他领导并带领着凤凰中心生物信息平台逐步稳定发展。并成立了分子系统课题组。Henning Hermjakob主要研究方向是数据标准化，数据整合，分布式数据库系统，和生物网络分析与可视化。

科研工作 :
代表性论文：一共发表201篇论文，H-index指数为59，被授予为汤森路透高被引科学家奖（在研究领域最高被引1%）
[1]. Griss J, et al. Recognizing millions of consistently unidentified spectra across hundreds of shotgun proteomics datasets. Nat Methods. 2016 Aug13(8):651-656. [2]. Deutsch EW1, et al. Human Proteome Project Mass Spectrometry Data Interpretation Guidelines 2.1. J Proteome Res. 2016 Nov 415(11):3961-3970.[3]. Fabregat A，et al. The Reactome pathway Knowledgebase. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 444(D1):D481-7. [4]. Perez-Riverol Y，et al. PRIDE Inspector Toolsuite: Moving Toward a Universal Visualization Tool for Proteomics Data Standard Formats and Quality Assessment of ProteomeXchange Datasets. Mol Cell Proteomics. 2016 Jan15(1):305-17.[5]. Swat MJ, et al. Pharmacometrics Markup Language (PharmML): Opening New Perspectives for Model Exchange in Drug Development. CPT Pharmacometrics Syst Pharmacol. 2015 Jun4(6):316-9.[6]. Chelliah V, et al. BioModels: ten-year anniversary. Nucleic Acids Res. 2015 Jan43 (Database issue): D542-8.[7]. Porras P, et al. A visual review of the interactome of LRRK2: Using deep-curated molecular interactions data to represent biology. Proteomics. 2015 Feb 3.[8]. Vizcaíno JA, et al. ProteomeXchange provides globally coordinated proteomics data submission and dissemination. Nat Biotechnol. 2014 Mar 1032(3):223-6.[9]. Orchard S, et al. The MIntAct project--IntAct as a common curation platform for 11 molecular interaction databases. Nucleic Acids Res. 2014 Jan42(Database issue):D358-63.[10]. Griss J, Foster JM, Hermjakob H, Vizcaíno JA. PRIDE Cluster: building a consensus of proteomics data. Nat Methods. 2013 Feb10(2):95-6.[11]. Orchard S, et al. Protein interaction data curation: the International Molecular Exchange (IMEx) consortium. Nat Methods. 2012 Mar 279(4):345-350.[12]. Wang R, et al. PRIDE Inspector: a tool to visualize and validate MS proteomics data. Nat Biotechnol. 2012 Feb 830(2):135-7. doi: 10.1038/nbt.2112.