导师姓名：陈兴
性别：男
人气指数：1215

所属院校：中国矿业大学
所属院系：信息与控制工程学院
职称：教授
导师类型：硕导/博导
招生专业：工程力学
研究领域： 现代分子系统生物学倡导人LeeHood教授将未来医学描述为以系统生物学为核心的P4医学（预... [展开]


研究领域： 现代分子系统生物学倡导人LeeHood教授将未来医学描述为以系统生物学为核心的P4医学（预测、预防、个性化和参与性为特点的医学的简称），早在2005年当时的卫生部长陈竺教授也著文“系统生物学21世纪医学和生物学发展的核心驱动力”.对于复杂疾病和药物治疗而言，传统的基于单靶点的药物设计、生物标志物的发现以及治疗方案，逐渐显得无能为力.当今转化医学、个性化医学和大数据的时代为系统生物学在医学中的应用提供了条件和挑战.本人从事生物信息学和系统生物学领域的相关研究，主要研究工作集中在开发和利用复杂网络、机器学习、深度学习、图论、组合数学等方法对于复杂疾病、非编码RNA和网络药理学方面的系统生物学领域的多个重要问题进行探索和研究，并取得一系列重要进展.研究方向包括致病基因识别、miRNA与疾病关系预测、疾病相关的非编码RNA-环境因子组合作用预测、lncRNA与疾病关系研究、非编码RNA大规模功能类似性网络构建、疾病-微生物关联预测研究、药物靶点预测、药物组合研究、蛋白质相互作用预测等.这些研究方向是近年来数学、计算机科学和生命科学等诸多领域交叉研究的前沿和热点，具有很重要的理论意义和实际指导意义.具体研究方向包括：
1.智能算法、机器学习、数据挖掘及其应用
2.大数据分析、处理和预测
3.生物信息学：网络药理学；非编码RNA和人类复杂疾病预测研究；复杂疾病和环境因子预测结果；复杂疾病和微生物预测研究；基因和人类复杂疾病预测研究；蛋白质相互作用预测
4.复杂网络及其应用需要解释的是，我们课题组的优势在于模型和算法，我们主要解决的是生物大数据的分析、处理和预测问题，所以计算机和自动化出身的同学不要有任何的顾虑，我们的生物问题很明确，不需要任何的已知生物基础，我们的数据也很齐全，我们只是将我们的技术方法应用到生物医学这样一个重要的领域！当然啦，我们也非常欢迎生物的人的加入，大家互相补充交叉合作 [收起]




通讯方式 :
办公电话：**
电子邮件：xingchen@cumt.edu.cn
通讯地址：江苏省徐州市大学路1号中国矿业大学南湖校区


个人简述 :
请报考控制科学与工程专业硕士研究生和控制理论与控制工程专业博士研究生的同学务必提前与我取得联系，xingchen@cumt.edu.cn陈兴，32岁，现任中国矿业大学信息与控制工程学院教授,博士生导师,中国矿业大学生物信息研究所所长,中国矿业大学首批越崎学者，江苏省第十四批“六大人才高峰”高层次人才，中国工业与应用数学学会数学生命科学专业委员会秘书长，辽宁省生物大分子计算模拟与信息处理工程技术研究中心专家委员会副主任，江苏省生物信息学专业委员会委员，江苏省人工智能学会智能系统与应用专业委员会委员。担任《BMCSystemsBiology》(SCI,五年平均影响因子2.726，数学与计算生物学中科院二区，JCR一区）杂志副主编。担任Nature旗下中科院二区杂志《ScientificReports》（影响因子4.259）、《CurrentProtein&PeptideScience》(SCI,影响因子2.576）、《JournalofBiochemistryandMolecularBiologyResearch》和《JournalofBiomolecularResearch&Therapeutics》杂志编委。担任中科院二区杂志《FrontiersinMicrobiology》(SCI,影响因子4.165)、中科院二区杂志《CurrentMedicinalChemistry》(SCI,影响因子3.455)、《CurrentProtein&PeptideScience》(SCI,影响因子3.154)、JCR二区杂志《CurrentTopicsinMedicinalChemistry》(SCI,影响因子2.9)、《BioMedResearchInternational》(SCI,影响因子2.134)、《Protein&PeptideLetters》(SCI,影响因子0.964)杂志的首席特约编委。陈兴从事生物信息学和系统生物学领域的相关研究，主要研究工作集中在开发和利用复杂网络、机器学习、深度学习、图论、组合数学等方法对于复杂疾病、非编码RNA和网络药理学方面的系统生物学领域的多个重要问题进行探索和研究，并取得一系列重要进展。研究方向包括致病基因识别、microRNA与疾病关系预测、疾病相关的非编码RNA-环境因子组合作用预测、lncRNA与疾病关系研究、非编码RNA大规模功能类似性网络构建、疾病-微生物关联预测研究、药物靶点预测、药物组合研究、蛋白质相互作用预测等。这些研究方向是近年来数学、计算机科学和生命科学等诸多领域交叉研究的前沿和热点，具有很重要的理论意义和实际指导意义。至今在Bioinformatics(影响因子7.307，2篇，数学与计算生物学中科院一区，均为第一作者兼通讯作者)、PlosComputationalBiology(影响因子4.542,2篇，数学与计算生物学中科院一区，1篇第一作者，1篇通讯作者)、NucleicAcidsResearch(影响因子10.162,生物大类中科院一区,1篇通讯作者)、BriefingsinBioinformatics(影响因子5.134，4篇，生物大类中科院一区，数学与计算生物学中科院一区，生化研究方法中科院一区，均为第一作者兼通讯作者)等国际期刊发表论文73篇（SCI论文68篇，EI检索3篇，影响因子累计约295），其中第一作者35篇,通讯作者53篇。以一作或者通讯发表中科院一区论文20篇，以一作或者通讯发表中科院二区以上论文38篇，以一作或者通讯发表JCR一区论文40篇。发表论文被NatureReviewsGenetics、NatureChemistry、NatureReviewsEndocrinology等国际著名杂志引用共计1511次，2017年7篇论文先后入选ESI高被引论文，目前4篇论文为ESI高被引论文，其中被影响因子5以上杂志他引200余次，H-因子为21，18篇论文基于谷歌学术引用次数超过30次，8篇论文基于谷歌学术引用次数超过50，基于谷歌学术单篇最高引用次数为313，参编专著4部，曾获教育部高等学校科学研究优秀成果奖自然科学奖二等奖、中国矿业大学越崎学者、江苏省第十四批“六大人才高峰”高层次人才、国际网络博弈论大会最佳论文奖、第七届图论与组合算法国际研讨会青年论文奖二等奖、第四届世界华人数学家大会新世界数学奖、中科院数学院院长奖学金、博时奖学金、永安期货奖学金、英达奖学金、美国数学建模竞赛国际一等奖等荣誉，主持或以骨干身份参与国家自然科学基金重点基金、国家自然科学基金重大研究计划、国家自然科学基金面上项目、国家自然科学基金青年基金、国家自然科学基金专项基金项目数学天元基金、江苏省第十四批“六大人才高峰”高层次人才项目、中国科学院国家数学与交叉科学中心数学与生物医学交叉研究部重大专项、中国矿业大学越崎学者人才引进项目、中国矿业大学学科前沿科学研究专项面上项目、广东省移动互联网应用中间件工程技术研究中心开发课题等16项重要项目。担任国际知名生物信息学杂志《BriefingsinBioinformatics》、《Bioinformatics》、《PLOSComputationalBiology》、《EuropeanJournalofHumanGenetics》、《JournalofMolecularBiology》、《Oncotarget》、《BMCGenomics》、《ScientificReports》、《MolecularBioSystems》、《PLoSONE》、《BMCBioinformatics》、《BMCSystemsBiology》、《InternationalJournalofMolecularSciences》、《IEEE/ACMTransactionsonComputationalBiologyandBioinformatics》、《MolecularGeneticsandGenomics》、《ExpertOpinionOnDrugMetabolismandToxicology》、《ComputerMethodsandProgramsinBiomedicine》、《RSCAdvances》、《BioMedResearchInternational》、《CellProliferation》、《TheScientificWorldJournal》、《Neurocomputing》、《IETSystemsBiology》、《CurrentBioinformatics》、《BulletinofMathematicalBiology》、《ComputationalBiologyandChemistry》、《TheoryinBiosciences》、《Complexity》、《QuantitativeBiology》、《CurrentProteomics》、《Genomics,Proteomics&Bioinformatics》、《ComputersinBiologyandMedicine》、《ActaMathematicaeApplicataeSinica》、《BiomedicalEngineering》、《ChineseJournalofBiochemistryMolecularBiology》、《MachineVisionandApplications》和国际会议The6thIEEEInternationalConferenceonSystemsBiology(ISB2012),The7thIEEEInternationalConferenceonSystemsBiology(ISB2013),The8thIEEEInternationalConferenceonSystemsBiology(ISB2014),The4thTranslationalBioinformaticsConference(TBC2014),InternationalConferenceonBioinformatics2014(InCoB2014),The10thIEEEInternationalConferenceonSystemsBiology(ISB2016)，ISMB/ECCB2017等的审稿人，担任ISB2012,ISB2013,ISB2014,TBC2014,ISB2016,ISBRA2017,ISB2017,ISBRA2018的程序委员会成员。担任北京青少年科技俱乐部活动委员会学术指导导师和《2012－2013运筹学学科发展报告》编写组成员。

科研工作 :
国家自然科学基金面上项目，**，多视角识别长非编码RNA和人类复杂疾病关联预测研究，2018/01-2018/12，19.2万，在研，项目主持广东省移动互联网应用中间件工程技术研究中心开发课题，疾病相关miRNA预测研究，2017/12-2018/11，5万，在研，项目主持江苏省第十四批“六大人才高峰”高层次人才项目，SWYY-089，长非编码RNA生物大数据处理和预测，2017/07-2020/06，4万，在研，项目主持中国矿业大学学科前沿科学研究专项面上项目，基于计算智能算法的药物靶点预测研究，2017/01-2019/12，20万，在研，项目主持国家自然科学基金重点基金，**，图理论和算法研究及其在生物信息学中的应用，2017/01-2021/12，230万，在研，项目骨干

中国矿业大学越崎学者人才引进项目，基于非编码RNA的生物大数据研究及生物信息研究所平台建设，2016/06-2021/05，200万，在研，项目主持

北京理工大学智能控制与复杂系统国家重点实验室基金，基于问题结构的自学习群智能优化生产调度理论与方法，2015/01-2015/12，3万，结题，项目骨干

国家自然科学基金青年基金，**，多视角识别人类复杂疾病相关microRNA的数学模型与方法研究，2014/01-2016/12，22万，在研，项目主持

国家自然科学基金专项基金项目数学天元基金，**，协同药物研发中的关键数学问题，2013/10-2014/09，20万，已结题，项目骨干

国家自然科学基金重大研究计划培育项目，**，非可控性炎症调控网络体内定量监视预测技术研究，2013/01-2015/12，110万，已结题，项目骨干

中国科学院国家数学与交叉科学中心数学与生物医学交叉研究部重大专项，重大慢性多发疾病的动态网络系统构建，2012/07-2016/05，参加

首都安全技术支撑平台（一期），安全生产数据挖掘与模型构建，2012/01-2013/06，结题，项目骨干

中国科学院研究生科技创新与社会实践资助专项科技创新类项目，药物靶点作用预测，2010/12-2012/06，2万，已结题，项目主持

中国科学院研究生科技创新与社会实践资助专项社会实践类项目，北京和威海青年创业现状分析及调研，2009/12-2010/12，1万，已结题，项目主持

北京市科技计划项目，城市公共设施事故应急的多部门协同决策模型研究，2009/06-2010/12，已结题，项目骨干

北京市科委课题，首都安全生产风险评估与预测预警技术研究的子课题安全生产数据挖掘与模型构建研究，2009/06-2010/12，已结题，项目骨干

中科院知识创新工程重要方向项目，生物分子网络中的模型与算法，2008/01-2012/12，已结题，参加