| 序号 | 一级学科名称 | 全国排名 | 序号 | 一级学科名称 | 全国排名 |
| 01 | 生物医学工程 | 1 | 12 | 公共卫生与预防医学 | 7 |
| 02 | 交通运输工程 | 1 | 13 | 控制科学与工程 | 11 |
| 03 | 艺术学理论 | 1 | 14 | 管理科学与工程 | 13 |
| 04 | 电子科学与技术 | 2 | 15 | 哲学 | 13 |
| 05 | 建筑学 | 2 | 16 | 电气工程 | 13 |
| 06 | 风景园林学 | 2 | 17 | 软件工程 | 16 |
| 07 | 土木工程 | 3 | 18 | 计算机科学与技术 | 17 |
| 08 | 城乡规划学 | 3 | 19 | 美术学 | 17 |
| 09 | 信息与通信工程 | 4 | 20 | 机械工程 | 22 |
| 10 | 仪器科学与技术 | 5 | 21 | 法学 | 29 |
| 11 | 动力工程及工程热物理 | 6 | 22 | 设计学 | 34 |
东南大学各级重点学科
国家重点学科
一级学科重点学科(5个)
1、电子科学与技术(物理电子学，电路与系统，微电子学与固体电子学，电磁场与微波技术)
2、信息与通信工程(通信与信息系统，信号与信息处理)
3、建筑学(建筑历史与理论，建筑设计及其理论，城市规划与设计，建筑技术科学)
4、交通运输工程(道路与铁道工程，交通信息工程及控制，交通运输规划与管理，载运工具运用工程)
5、生物医学工程(不分设二级学科)[16]
二级学科重点学科(5个)
艺术学，热能工程，控制理论与控制工程，计算机应用技术，结构工程[16]
国家重点(培育)学科(1个)
机械制造及其自动化[16]
国家重点学科培育点(6个)
机械制造及其自动化，精密仪器及机械，热能工程
物理电子学，防灾减灾工程及防护工程，道路与铁道工程[16]
江苏省重点学科(16个)
艺术学，学习科学，电力系统及其自动化，电机与电器
材料学，岩土工程，微电子学与固体电子学，计算机软件与理论
遗传学，应用化学，影像医学与核医学，管理科学与工程
伦理学，应用数学，劳动卫生与环境卫生学，制冷及低温工[16]
科研机构
重点实验室
国家实验室(1个)
南京通信技术国家实验室(筹)[30]
国家重点实验室(3个)
毫米波国家重点实验室，移动通信国家重点实验室，生物电子学国家重点实验室(吴健雄实验室)
国家工程实验室(1个)
新型道路材料国家工程实验室[31]
国家专业实验室(1个)
计算机辅助建筑设计(CAAD)国家专业实验室
教育部委重点实验室(12个)
计算机网络和信息集成教育部重点实验室、混凝土及预应力混凝土结构教育部重点实验室、微电子机械系统教育部重点实验室、发育与疾病相关基因教育部重点实验室(部省共建)、儿童发展与学习科学教育部重点实验室，复杂工程系统测量与控制教育部重点实验室、城市与建筑遗产保护教育部重点实验室、环境医学工程教育部重点实验室、微惯性仪表与先进导 航技术教育部重点实验室、水声信号处理教育部重点实验室、能源热转换及其过程测控教育部重点实验室、能源热转换及其过程测控教育部重点实验室。
