1.非特异性结构药物（structurally nonspecific drug）：药物的生物活性和化学结构关系不大与理化性质有关。
2.特异性结构药物（structurelly specific drug）：药物的作用依赖于药物分子的特异化学结构及空间相互排列。
3.新药（New Chemical Entity）（NCE）：第一次用作药物的化学实体。
4.合理药物设计（rational drug design）：根据对生理病理的了解来研究新药。
5.组合化学（combinational chemistry）：对含有数十万乃至数百万化合物的化学品库进行同步的合成和筛选。
6.非合理药物设计（irrational drug design）：采用构建大量不同结构的化合物库，并不进行混合物的分离，通过高通量筛选，发现其组分具有生物活性后再进行分离，并确定其活性化合物的结构。
7.原药（母体药物）（parent drug）：药物在体内转化后起作用的活性形式。
8.前药（prodrug）：药物未被转化前，相应的在体内无活性或者低活性的形式。
9.载体联合前药（carrier-prodrug）：由一个活性药物和一个可被酶除去的载体部分连接的前药。
10.生物前体前药(bioprecursor)：相对载体联结前药而言，在体内经过酶的催化除水解反应外的氧化、还原、磷酸化和脱羧反应等方式活化的前药。
11.硬药（hard drugs）：在体内不受任何酶攻击的有效药物。
12.软药（soft drugs）：容易代谢失活的药物，使药物在完成治疗作用后，按预先规定的代谢途径和可以控制的速率分解，失活并迅速排除体外，从而避免药物的蓄积毒性。
13.构效关系（SAR）：药物化学结构与活性的关系。
14.先导化合物（Lead Compound ）：简称先导物，具有一定的生理活性的化合物，根据其结构进行改造能合成新型药物的化合物。
15.电子等排体（ isostere ）：具有类似的电子或立体构型的原子集团或分子，如最外层电子书相等，基团的空间构型中的夹角相等。
16.生物电子等排体（ bioisostere ）:产生相似或拮抗的生物活性，并且具有相似物理或者化学性质的分子或基团。
17.拼合原理（principle of hybridization）：把两个具有生物活性的化合物利用共价键连接起来，待进入体内后缓慢水解成原来的两个化合物，以协同加强药效，降低毒副作用。
18.生物烷化剂（biological alkylating agent）：也称烷化剂，属于细胞毒类药物，在体内能形成缺电子活泼中间体或其他具有活性的亲电性基团的化合物，进而与生物大分子中含有丰富电子的基团 进行亲电反应和共价结合，使生物大分子丧失活性或使DNA分子发生断裂。
19.代谢拮抗（metabolic antagonism）：设计与生物体内基本代谢物的结构有某种程度相似的化合物，使与基本代谢产物竞争性或干扰基本代谢产物的被利用，或掺入生物大分子的合成之中形成伪生物 大分子，导致致死合成，从而影响细胞的生长。