中间代谢；代谢过程中各种中间反应过程。
代谢途径；在生物体内把从A到X的酶反应常规程序（A→B→C→……X），称为A至X的代谢途径。
酶联免疫吸附测定；（简写ELISA）指将可溶性的抗原或抗体结合到聚苯乙烯等固相载体上，利用抗原抗体结合专一性进行免疫反应的定性和定量检测方法。
超过滤；一种以压力差为推动力，按粒径选择分离溶液中所含的微粒和大分子的膜分离操作。
转化；是某一基因型的细胞从周围介质中吸收来自另一基因型的细胞的DNA而使它的基因型和表现型发生相应变化的现象。
转染；指真核细胞由于外源DNA掺入而获得新的遗传标志的过程。
图位克隆；又称定位克隆，用该方法分离基因是根据目的基因在染色体上的位置进行的，无需预先知道基因的DNA 顺序，也无需预先知道其表达产物的有关信息。
亚克隆：(subclone) 分为细胞克隆和分子克隆。
在细胞克隆中，对培养的细胞来说，从原有的克隆中，再筛选出具有某种特性的细胞进行培养，就是亚克隆subclone。在分子克隆中，从大片段的克隆中选取特定小片段再克隆，也叫subclone。
基因工程；基因工程（genetic engineering）又称基因拼接技术和DNA重组技术，是以分子遗传学为理论基础，以分子生物学和微生物学的现代方法为手段，将不同来源的基因按预先设计的蓝图，在体外构建杂种DNA分子，然后导入活细胞，以改变生物原有的遗传特性、获得新品种、生产新产品。基因工程技术为基因的结构和功能的研究提供了有力的手段。
蛋白质工程，是指在基因工程的基础上，结合蛋白质结晶学，计算机辅助设计和蛋白质化学等多学科的基础知识通过对基因的人工定向改造等手段，对蛋白质进行修饰，改造和拼接以生产出能满足人类需要的新型蛋白质的技术。
限制性核酸内切酶；是可以识别DNA特异序列，并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶，简称限制酶。根据限制酶的结构，辅因子的需求切位与作用方式，可将限制酶分为三种类型，分别是第一型（Type I）、第二型（Type II）及第三型（Type III）。Ⅰ型限制性内切酶既能催化宿主DNA的甲基化，又催化非甲基化的DNA的水解；而Ⅱ型限制性内切酶只催化非甲基化的DNA的水解。III型限制性内切酶同时具有修饰及认知切割的作用。
同尾酶；切割不同的DNA片段但产生相同的粘性末端的一类限制性内切酶
同裂酶；有一些来源不同的限制酶识别的是同样的核苷酸靶子序列，这类酶称为同裂酶。同裂酶的切割位点可能不同，识别序列和切割位点都相同的叫同序同切酶，识别序列相同但切割位点不同的叫同序异切酶。
严紧控制；基因转录的一种调控。细菌在氨基酸饥饿时迅速停止生成rRNA、tRNA和核糖体蛋白质。
载体；指在基因工程重组DNA技术中将DNA片段（目的基因）转移至受体细胞的一种能自我复制的DNA分子。三种最常用的载体是细菌质粒、噬菌体和病毒。
松弛控制；质粒的复制不受宿主染色体复制过程的严格控制。
平末端；当限制酶从识别序列的中心轴线处切开时，切开的DNA两条单链的切口，是平整的，这样的切口叫平末端。
黏性末端；被限制酶切开的DNA两条单链的切口，带有几个伸出的核苷酸，它们之间正好互补配对，这样的切口叫黏性末端。
开放阅读框[open reading frame，ORF] 是结构基因的正常核苷酸序列，从起始密码子到终止密码子的阅读框可编码完整的多肽链，其间不存在使翻译中断的终止密码子。
质粒；质粒存在于许多细菌以及酵母菌等生物中，是细胞染色体外能够自主复制的很小的环状DNA分子。
基因组，一个细胞或者生物体所携带的一套完整的单倍体序列，包括全套基因和间隔序列。
报告基因 (reporter gene)是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因，也就是说，是一个其表达产物非常容易被鉴定的基因。
基因芯片技术；基因芯片技术由于同时将大量探针固定于支持物上，所以可以一次性对样品大量序列进行检测和分析，从而解决了传统核酸印迹杂交（Southern Blotting 和 Northern Blotting 等）技术操作繁杂、自动化程度低、操作序列数量少、检测效率低等不足。
cDNA文库；以mRNA为模板，经反转录酶催化，在体外反转录成cDNA，与适当的载体（常用噬菌体或质粒载体）连接后转化受体菌，则每个细菌含有一段cDNA，并能繁殖扩增，这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。
糖酵解；是指将1个葡萄糖分解为2个丙酮酸，同时生成2个ATP和NADH+H﹢的过程。
巴斯德效应；在厌氧条件下,向高速发酵的培养基中通入氧气,则葡萄糖消耗减少。这种抑制发酵产物积累的现象称为巴斯德效应。
无效循环（futile cycle）也称之底物循环（substrate cycle）。一对由不同的酶催化的方向相反且代谢上不可逆的、在中间代谢物之间循环的反应。
糖的有氧氧化；葡萄糖在有氧条件下彻底氧化成水和二氧化碳的反应过程就叫做有氧氧化，并且有氧氧化是糖氧化的主要方式，绝大多数细胞都通过它来获得能量。
底物水平磷酸化（substrate level phosphorylation）：物质在生物氧化过程中，常生成一些含有高能键的化合物，而这些化合物可直接偶联ATP或GTP的合成，这种产生ATP等高能分子的方式称为底物水平磷酸化。
磷酸解作用（phosphorolysis）：通过在分子内引入一个无机磷酸，形成磷酸脂键而使原来键断裂的方式。实际上引入了一个磷酰基。
糖异生作用（gluconenogenesis）：由简单的非糖前体转变为糖的过程。糖异生不是糖酵解的简单逆转。虽然由丙酮酸开始的糖异生利用了糖酵解中的七步进似平衡反应的逆反应，但还必需利用另外四步酵解中不曾出现的酶促反应，绕过酵解过程中不可逆的三个反应。
丙酮酸脱氢酶系，是一种催化丙酮酸脱羧反应的多酶复合体，由三种酶（丙酮酸脱氢酶、二氢硫辛酰转乙酰基酶、二氢硫辛酸脱氢酶）和六种辅助因子（焦磷酸硫胺素、硫辛酸、FAD、NAD、CoA和Mg离子）组成，在它们的协同作用下，使丙酮酸转变为乙酰CoA和CO2。
磷酸戊糖途径（pentose phosphate pathway）葡萄糖氧化分解的一种方式。由于此途径是由6-磷酸葡萄糖（G－6－P）开始，故亦称为己糖磷酸旁路。此途径在胞浆中进行，可分为两个阶段。第一阶段由G－6-P脱氢生成6-磷酸葡糖酸内酯开始，然后水解生成6-磷酸葡糖酸，再氧化脱羧生成5-磷酸核酮糖。NADP+是所有上述氧化反应中的电子受体。第二阶段是5-磷酸核酮糖经过一系列转酮基及转醛基反应，经过磷酸丁糖、磷酸戊糖及磷酸庚糖等中间代谢物最后生成3-磷酸甘油醛及6-磷酸果糖，后二者还可重新进入糖酵解途径而进行代谢。
糖醛酸途径；从葡萄糖-6-磷酸或葡萄糖-1-磷酸开始，经UDP-葡萄糖醛酸生成葡萄糖醛酸和抗坏血酸的途径。
半乳糖血症；半乳糖血症为血半乳糖增高的中毒性临床代谢综合征。半乳糖代谢中有3种相关酶中的任何一种酶先天性缺陷均可致半乳糖血症。
乳酸循环（Lactic acid cycle)肌肉收缩通过糖酵解生成乳酸。在肌肉内无6—P—葡萄糖酶，所以无法催化葡萄糖—6—磷酸生成葡萄糖。所以乳酸通过细胞膜弥散进入血液后，再入肝，在肝脏内在乳酸脱氢酶作用下变成丙酮酸，接着通过糖异生生成为葡萄糖。葡萄糖进入血液形成血糖，后又被肌肉摄取，这就构成了一个循环(肌肉-肝脏-肌肉），此循环称为乳酸循环。
糖原累积症又称糖原贮积症、糖原贮积病，是少见的一组常染色体相关的隐性遗传病，患者不能正常代谢糖原，使糖原合成或分解发生障碍，因此糖原大量沉积于组织中而致病。
Q酶(分支酶)；在合成糖原或支链淀粉的酶催化类似葡聚糖链的一个1,4 -α-葡聚糖链的各个环节转移到主羟基。
R酶（脱支酶）；催化水解葡聚糖链分支点处１，６-D-糖苷键的酶。
极限糊精；糖原磷酸酶可以从糖原的非还原端连续地进行磷酸解，磷酸解直至距α-1，6糖苷键的分支点还剩下4个葡萄糖单位的部位停止，剩下的底物称为极限糊精。
糖原合酶；是糖原合成过程的限速酶.糖原合成由糖原合酶催化使UDPG中的葡萄糖基与糖原引物的非还原端分支上的葡萄糖基聚合，.糖原合酶不能从头合成糖原，只能在现有糖原（糖原引物）上延长糖链，即糖原合成的过程是小分子糖原变成大分子糖原的过程。
淀粉合成酶；以腺苷二磷酸葡萄糖（ADPG）为葡萄糖的供体，是对葡糖聚合体，通过糖基（glycosyl）转移而催化α－1，4-糖苷键的延长作用的酶。
氧化磷酸化，生物化学过程，在真核细胞的线粒体或细菌中，是物质在体内氧化时释放的能量供给ADP与无机磷合成ATP的偶联反应。
脂蛋白；脂类脂蛋白英文：lipoproteins，与蛋白质结合在一起形成的脂质-蛋白质复合物。
血浆脂蛋白：指哺乳动物血浆（尤其是人）中的脂-蛋白质复合物。血浆脂蛋白可以把脂类（三酰甘油、磷脂、胆固醇）从一个器官运输到另一个器官。
酮体（ketone body）：在肝脏中，脂肪酸氧化分解的中间产物乙酰乙酸、β-羟基丁酸及丙酮，三者统称为酮体。
脂肪动员；储存在脂肪细胞中的脂肪，被脂肪酶逐步水解为游离脂酸（FFA）及甘油并释放入血液，被其他组织氧化利用，该过程称为脂肪动员。
脂肪酸合酶（fatty acid synthase FAS）系统是一个多酶复合体，包括酰基载体蛋白（ACP）和6 种酶，它们分别是：乙酰CoA；丙二酸单酰CoA；β-酮脂酰-ACP 合酶；β-酮脂酰-ACP 还原酶；β-羟脂酰-ACP 脱水酶；烯脂酰-ACP 还原酶，在脂肪酸的从头合成中起催化作用。
次级胆汁酸是由初级胆汁酸随胆汁进入肠道，在回肠、结肠上段，由肠道菌酶催化，经去结合反应，脱去羟基转化而成。包括脱氧胆酸和石胆酸，分别由胆酸和鹅脱氧胆酸转化而成，属于次级游离型胆酸。
尿素循环（urea cycle）：又称为鸟氨酸循环，肝脏中2分子氨（1分子氨是游离的，1分子氨来自天冬氨酸）和1分子CO2生成1分子尿素的环式代谢途径。
转氨基作用；指的是一种α-氨基酸的α-氨基转移到一种α-酮酸上的过程。转氨基作用是氨基酸脱氨基作用的一种途径。
联合脱氨基作用；转氨基作用和谷氨酸脱氢酶催化的氧化脱氨基作用两种方式联合起来进行脱氨基。
丙氨酸-葡萄糖循环；肌肉中的氨基酸将氨基转给丙酮酸生成丙氨酸，后者经血液循环转运至肝脏经过联合脱氨基作用再脱氨基，放出的氨用于合成尿素；生成的丙酮酸经糖异生转变为葡萄糖后再经血液循环转运至肌肉重新分解产生丙酮酸，丙酮酸再接受氨基生成丙氨酸。
生酮氨基酸，分解代谢过程中能转变成乙酰乙酰辅酶A的氨基酸，共有亮氨酸、赖氨酸、色氨酸、苯丙氨酸和酪氨酸5种，这些氨基酸能在肝中产生酮体，因为乙酰乙酰辅酶A能转变成乙酰乙酸和β-羟基丁酸。
生酮氨基酸，能通过代谢转变成葡萄糖的氨基酸。包括丙氨酸、精氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、组氨酸、甲硫氨酸、脯氨酸、丝氨酸、苏氨酸、异亮氨酸、缬氨酸等15种。
一碳单位；就是指具有一个碳原子的基团。指某些氨基酸分解代谢过程中产生含有一个碳原子的基团，包括甲基、亚甲基、甲烯基、甲炔基、甲酰基及亚氨甲酰基等。
自杀底物；是一类酶的天然底物的衍生物或类似物，在它们的结构中含有一种化学活性基团，当酶把他们作为底物结合时，其潜在的化学基团能被解开或激活，并与酶的活性部位发生共价结合，使结合物停留在某种状态，从而不能分解成产物，酶因而致“死”，此过程称为酶的自杀，这类底物称为自杀底物(suicide substrate)。
核苷酸（hé gān suān） Nucleotide，一类由嘌呤碱或嘧啶碱、核糖或脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的化合物。又称核甙酸。
复制子（replicon）：是DNA复制是从一个DNA复制起点开始，最终由这个起点起始的复制叉完成的片段。
滚环复制；亲代双链DNA的一条链在DNA复制起点处被切开，其5'端游离出来。这样，DNA聚合酶Ⅲ便可以将脱氧核糖核苷酸聚合在3'-OH端。当复制向前进行时，亲代DNA上被切断的5'端继续游离下来，并且很快被单链结合蛋白所结合。因为5'端从环上向下解链的同时伴有环状双链DNA环绕其轴不断的旋转，而且以3'-OH端为引物的DNA生长链则不断地以另一条环状DNA链为模板向前延伸，因而称为滚环复制。
DNA聚合酶（DNA polymerase）是细胞复制DNA的重要作用酶,以DNA为复制模板，从将DNA由5'端点开始复制到3'端的酶。