武汉大学考研分子生物学名词解释(6)

本站小编 免费考研网/2016-09-23


9. 染色质免疫沉淀法(Chromatin immunoprecitation,ChIP) 是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况,还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。它能真实、完整地反映结合在DNA序列上的调控蛋白,是目前确定与特定蛋白结合的基因组区域或确定与特定基因组区域结合的蛋白质的一种很好的方法。 
10. rho-dependent transcription termination




08名解
1.表观遗传(epigenetics)是指DNA序列不发生变化,但基因表达却发生了可遗传的改变。这种改变是细胞内除了遗传信息以外的其他可遗传物质发生的改变,且这种改变在发育和细胞增殖过程中能稳定传递。
表观遗传改变从以下3个层面上调控基因的表达,DNA修饰:DNA共价结合一个修饰基团,使具有相同序列的等位基因处于不同的修饰状态;蛋白修饰:通过对特殊蛋白修饰或改变蛋白的构象实现对基因表达的调控;非编码RNA的调控:RNA可通过某些机制实现对基因转录的调控以及对基因转录后的调控,如RNA干扰(RNA interference,RNAi)。表观遗传学研究包括染色质重塑、DNA甲基化、X染色体失活,非编码RNA调控4个方面,任何一方面的异常都将影响染色质结构和基因表达,导致复杂综合征、多因素疾病以及癌症。 2. 肽指纹图谱(Peptide Mass Fingerprinting, PMF)
测定对蛋白酶解或降解后所得多肽混合物进行质谱分析的方法。质谱分析所得肽断与多肽蛋白数据库中蛋白质的理论肽断进行比较,判断出所测蛋白是已知还是未知。由于不同的蛋白质具有不同的氨基酸序列,不同蛋白质所得肽断具有指纹特征。采用肽指纹谱的方法已对酵母、大肠杆菌、人心肌等多种蛋白质组进行了研究。 3. RNA剪接RNA splicing
除去初级转录产物中的内含子,并将外显子连接起来,形成成熟的RNA分子的过程。 4. 管家基因house-keeping gene
生物体各类细胞中都表达,对维持细胞存活和生长所必需的蛋白质编码的基因。 5. frameshift mutation  在基因编码区,核苷酸插入或缺失导致三联体密码子阅读方式的改变,从而使该基因的相应编码序列发生改变。
6. DNA binding domainDNA结合域 
7.Shine-dalgarno sequence SD序列
SD序列是原核生物mRNA中5'端富含嘌呤的短核苷酸序列,一般位于mRNA的起始密码AUG的上游3至11个核苷酸处,并且同16S rRNA 3'端的序列互补。 8. gel retardation凝胶阻滞
该方法用来研究DNA与特异性蛋白的相互作用,通常是放射性标记的DNA片段与纯化蛋白,或提取物中的蛋白混合物相结合,然后在非变性凝胶中分析该产物。与游离DNA相比,蛋白-DNA复合物的迁移率将降低,因此,与游离DNA相对应,人们将观察到带中的“阻滞”。
9. 染色质免疫沉淀法(Chromatin immunoprecitation,ChIP) 是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况,还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。它能真实、完整地反映结合在DNA序列上的调控蛋白,是目前确定与特定蛋白结合的基因组区域或确定与特定基因组区域结合的蛋白质的一种很好的方法。
10. rho-dependent transcription termination 


 

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2009年
一. 名词解释
1. 调节基因regulatory gene
控制编码RNA基因或蛋白质基因表达的基因。如编码激活蛋白或阻遏蛋白的基因。 也就是,一段有效的DNA片段,它可转录翻译而产生调节蛋白,该蛋白质与操纵基因相互作用,而对操纵子的活动进行控制。 2. real time PCR实时PCR
一种新的核酸微量分析技术,是引入荧光标记分子,在PCR反应中产生的荧光信号,与PCR产物量成正比,对每一反应时刻的荧光信号进行分析,计算出PCR的产物量。 3. 切口平移nick translation
制备标记DNA的一种方法。先用DNA酶使DNA双链上形成不对称的切口,再利用DNA聚合酶Ⅰ的5′→3′外切酶活性将切口处的5′-P-核苷酸逐个切除,同时其DNA聚合酶活性又不断将新的含标记的核苷酸按碱基配对原则加入形成新链,这样就使缺口不断向3′端移动,同时标记了DNA。 4. 通用启动子generic promoter
(核心启动子)RNA聚合酶正常起始转录所必需的最小DNA序列。RNA聚合酶Ⅱ识别的启动子通常包含转录起始位点及其上游或下游约35个核苷酸的序列,大小约为40个核苷酸。含有TATA框,起始子(Inr),TFⅡB识别元件(BRE)和核心启动子下游元件(DPE)等序列模块。
5.组蛋白密码 Histone code 
所谓组蛋白密码就是对结合DNA的组蛋白进行一系列修饰,从而影响某些基因何时以及以何种方式被打开或关闭。
6. 蛋白质组学proteomics 
阐明生物体各种生物基因组在细胞中表达的全部蛋白质的表达模式及功能模式的学科。包括鉴定蛋白质的表达、存在方式(修饰形式)、结构、功能和相互作用等。 7. 基因打靶gene targeting
通过DNA分子同源重组,特异性改变基因组中靶基因序列,以研究目标基因的体内功能或相关疾病发病机制的一种基因操作技术。
8. 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)
 不同物种、个体基因组DNA序列同一位置上的单个核苷酸存在差别的现象。有这种差别的基因座、DNA序列等可作为基因组作图的标志。人基因组上平均约每1000个核苷酸即可能出现1个单核苷酸多态性的变化,其中有些单核苷酸多态性可能与疾病有关,但可能大多数与疾病无关。单核苷酸多态性是研究人类家族和动植物品系遗传变异的重要依据。
9. alternative mRNA processing
alternative splicing选择性剪接(也叫可变剪接)是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点组合)产生不同的mRNA剪接异构体的过程,而最终的蛋白产物会表现出不同或者是相互拮抗的功能和结构特性,或者,在相同的细胞中由于表达水平的不同而导致不同的表型。 10. 复制子replicon 
作为含有一个复制起始点的独立复制单元的一个完整DNA分子或DNA分子上的某段区域。质粒、细菌染色体和噬菌体等通常只有一个复制起始点,因而其DNA分子就构成一个复制子;真核生物染色体有多个复制起始点,因而含有多个复制子。


 


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