4.8.Single nucleotide polymorphism（snp）
9.Alternative mRNA processing（选择性剪接）          
5.10.Replicon（复制子）
二、        简答题
1.        什么是DNA损伤？生物体DNA损伤与哪些因素有关？生物细胞有哪些机制来处理DNA损伤，并进行DNA损伤修复？
2.        表观（epigenetic）遗传修饰包括哪些内容？并举一例说明其在基因的表达调控和染色体重塑等方面有哪些重要作用？
3.        反式作用因子是直接或间接地识别或结合在各类顺式作用元件上参与调控靶基因转录效率的蛋白质，试问反式作用因子的DNA结合结构域有哪几种类型？特点如何？
4.        PCR的原理是什么？在PCR反应中是否循环次数越多所合成的产物数量也越多？为什么？
5.        增强子和绝缘子在基因表达调控中的作用和特点有哪些？
三、        论述题
1.        论述转座子的类别、结构和转座机制及在基因表达与分子进化中的作用。
2.        在进行遗传重组和基因克隆与表达的研究中，对分子克隆的载体与宿主系统的选择有非常重要的作用。请论述各主要载体系统的特点及其宿主系统。
3.        从转录后水平上进行比较，论述原核生物和真核生物RNA加工的异同点。
4.        什么是HapMap（遗传图谱是某一物体的染色体图谱（也就是我们所指的连锁图谱）显示所知的基因或遗传标记的相对位置，而不是在每条染色体上特殊的物理位置。）计划、ENCODE计划（DNA元件百科全书计划）、Jim计划（吉姆工程是美国454生命科学公司（基因技术公司）在2005年前给“DNA之父”称誉的美国科学家詹姆斯•沃森绘制完整的个人基因组图谱的工作。）、Proteome计划（蛋白质组计划）？这些计划与人类基因组计划有何联系？这些计划对分子生物学的发展和生命活动的分子机制有什么影响和意义？

2011年3月2日星期三
一、科学名词解释及翻译
1.Chromatin remodeling（染色质重塑    DNA 复制、转录、修复、重组在染色质水平发生，这些过程中，染色质重塑可导致核小体位置和结构的变化，引起染色质变化。ATP 依赖的染色质重塑因子可重新定位核小体，改变核小体结构，共价修饰组蛋白。重塑包括多种变化，一般指染色质特定区域对核酶稳定性的变化。人们发现体内染色质结构重塑存在于基因启动子中，转录因子TF 以及染色质重塑因子与启动子上特定位点结合，引起特定核小体位置的改变（滑动），或核小体三维结构的改变，或二者兼有，它们都能改变染色质对核酶的敏感性。关于重塑因子调节基因表达机制的假设有两种： 机制1） 1 个转录因子独立地与核小体DNA 结合（DNA 可以是核小体或核小体之间的），然后，这个转录因子再结合1 个重塑因子，导致附近核小体结构发生稳定性的变化，又导致其他转录因子的结合，这是一个串联反应的过程； 机制2） 由重塑因子首先独立地与核小体结合，不改变其结构，但使其松动并发生滑动，这将导致转录因子的结合，从而使新形成的无核小体的区域稳定。）
2.Internal ribosome entry site （内部核糖体进入位点     内部核糖体进入位点，缩写IRES，是一段核酸序列，它的存在能够使蛋白质翻译起始不依赖于5‘帽结构，从而使直接从信使RNA（mRNA）中间起始翻译成为可能。通常来讲，真核生物翻译只能从mRNA的5‘端开始，因为翻译起始必须依赖于5’端的帽子结构。一般来讲，内部核糖体进入位点通常位于RNA病毒基因组的5’非翻译区（UTR），这样病毒蛋白的翻译就可以不依赖于5‘帽子结构。）
3.Alternative splicing(选择性剪接)
4.Non-autonomous transposon（非自主转座子）
5.Shine-Dalgarno equence
6.Realtime PCR
7.Ribozyme（核酶）
8.SOS response（sos应答）
9.Telomerase（端粒酶）
10.Suppressor mutation（抑制因子突变）
二、简答题
1.简述色氨酸操纵子的调控机制。
2.DNA在复制过程中如何保持准确性？
3.分别阐述克隆载体和表达载体（各5种）及其特点和用途。
4.什么是RNA editing？它的机制是什么？
5.什么是染色体步移？它的作用是什么？
三、论述题
1.真核生物转录调控因子的类型和特点？阐述根据一种转录调控因子的特点建立的分子生物学技术的及其应用。
2.真核生物和原核生物的基因组的特点及差异？已知某基因的cDNA（长14Kb），如何用实验证明该生物基因还有内含子？如何确定内含子在全长中的比例？如何用实验确定某未知基因的功能？
3.每种基因a是诱导表达基因，在分子B（小分子化合物）的作用下可以诱导表达。已知该基因的序列，该基因上启动子的序列。已知某调控元件的序列为ACGTCG，基因c表达的蛋白C可以结合在该调控元件上，试用三种证明该调控元件可以诱导基因a表达。
武汉大学
2013年攻读硕士研究生入学考试微生物试题
一、名词解释（共10小题，每题4分，共40分）
1.  Ribozyme
2.  Missense  Mutation
3.  Insulator(绝缘子)
4.  RNA  trans-splicing（RNA反式剪接 指的是两条不同的pre-mRNA的外显子连接到一起。与正常的顺式剪接不同，这里的两段外显子是来自不同的pre-mRNA的，但却可能来自同一基因。“经典”反式剪接见于锥虫和线虫，近期在人类身上也发现了反式剪接。）
5.  Nucleotide  excision  repair(核苷酸切除修复)
6.  Transposon（转座子）
7.  Dam  methylase（dam甲基化酶   Dam 甲基化酶可在 GATC 序列中的腺嘌呤 N6 位置上引入甲基。一些限制酶（PvuⅡ, BamHⅠ、BclⅠ、BglⅡ、XhoⅡ、MboⅠ、 Sau3AⅠ）的识别位点中含 GATC 序列，另一些酶 ClaⅠ（1/4）、 XbaⅠ（1/16）、TaqⅠ（1/16）、MboⅠ（1/16）、 HphⅠ（1/16） 的部分识别序列含此序列，如平均 4 个 ClaⅠ 位点（ATCGATN）中就有一个该序列。
有些限制酶对 Dam 甲基化的 DNA 敏感，不能切割相应的序列，如 BclⅠ、 ClaⅠ、 XbaⅠ 等。对甲基化不敏感的有 BamHⅠ、 Sau3AⅠ、 BglⅡ、 PvuⅠ 等。 MboⅠ 和 Sau3AⅠ 识别和切割位点相同，但其差异就在于前者对甲基化敏感。
一般哺乳动物 DNA 不会在腺嘌呤 N6 上甲基化，因此对甲基化敏感的限制酶切割这些 DNA 不会受到影响。当需要在这些敏感位点上完全切割 DNA 时，可利用 dam- E.coli 扩增并提取 DNA 。）
8.  Spliceosome（剪接体）
9.  Core  promotor
10.  SNP
二、简答题（共5小题，每题10分，共50分）
1.  真核生物mRNA的5’帽子结构有何生物学功能？其缺失会造成什么后果？
2.  某一基因开放阅读框中的一个碱基突变会对该基因编码产物产生什么影响？
3.  请简述真核生物的mRNA和原核生物的mRNA有何不同。
4.  请简述Ⅰ型内含子剪切的过程.
5.  请简述Western blot 的原理和步骤。
三、论述题（共3小题，每题20分，共60分）
1.  研究基因功能通常是降低或升高基因表达水平，请简要说出三种相关研究方法及原理。

2.  mRNA和蛋白质的降解是一个有序的过程，其中microRNA和泛素起了非常重要的作用，请简述microRNA的概念、产生过程、作用机制，或者泛素的概念和蛋白质泛素化的过程。

3.  某实验需将1kb的cDNA片段插入某氨苄青霉素抗性的表达载体，在片段两边各有一个EcoRI位点，靠近5’端300bp的地方有一EcoRV位点，载体多克隆位点从5’依次为BamHI、HindIIII、EcoRI、EcoRV、XhoI位点，实验设计步骤如下：
（1）用EcoRI处理载体，然后用碱性磷酸酶处理。
（2）用EcoRI处理片段，然后与步骤（1）中的载体混合，加入DNA连接酶，在适当的条件下使cDNA片段与载体连接。
（3）连接产物转化到大肠杆菌，并在含有氨苄青霉素的LB平板上生长，除此之外，还设了以下对照：
对照1：在含有抗生素的平板上涂布未被转化的大肠杆菌感受态细胞。
对照2：用未被酶切处理的载体转化大肠杆菌感受态细胞，并在含有抗生素的平板上生长。
对照3：用EcoRI处理的载体，不用碱性磷酸酶处理，不加cDNA片段，然后加连接酶做连接反应，并转化大肠杆菌感受态细胞，并在含有抗生素的平板上生长。
对照4：除了用碱性磷酸酶处理外，其他同对照3.
某学生做了三次试验，结果如表：
    克隆数
    实验1    实验2    实验3
对照1    太多，无法计算    0    0
对照2    太多，无法计算    0    大于1000
对照3    太多，无法计算    0    350
对照4    太多，无法计算    0    25
实验组    太多，无法计算    0    34
请回答下列问题：
问题1：四个对照组各有什么用？
问题2：为什么要用碱性磷酸酶处理？
问题3：哪次实验数据比较合理？为什么？其他次实验失败的原因是什么？
问题4：设计实验鉴定克隆是否正确？



2010年  一．名词解释
 1.表观遗传（epigenetics）是指DNA序列不发生变化，但基因表达却发生了可遗传的改变。这种改变是细胞内除了遗传信息以外的其他可遗传物质发生的改变，且这种改变在发育和细胞增殖过程中能稳定传递。  表观遗传改变从以下3个层面上调控基因的表达，DNA
修饰：DNA共价结合一个修饰基团，使具有相同序列的等位基因处于不同的修饰状态；
蛋白修饰：通过对特殊蛋白修饰或改变蛋白的构象实现对基因表达的调控；非编码RNA
的调控：RNA可通过某些机制实现对基因转录的调控以及对基因转录后的调控，如RNA干扰(RNA interference,RNAi)。表观遗传学研究包括染色质重塑、DNA甲基化、X染色体失活，非编码RNA调控4个方面，任何一方面的异常都将影响染色质结构和基因表达，导致复杂综合征、多因素疾病以及癌症。 2. 肽指纹图谱(Peptide Mass Fingerprinting, PMF)  测定对蛋白酶解或降解后所得多肽混合物进行质谱分析的方法。质谱分析所得肽断与多肽蛋白数据库中蛋白质的理论肽断进行比较，判断出所测蛋白是已知还是未知。由于不同的蛋白质具有不同的氨基酸序列，不同蛋白质所得肽断具有指纹特征。采用肽指纹谱的方法已对酵母、大肠杆菌、人心肌等多种蛋白质组进行了研究。
3. RNA剪接RNA splicing  除去初级转录产物中的内含子，并将外显子连接起来，形成成熟的RNA分子的过程。
4. 管家基因house-keeping gene  生物体各类细胞中都表达，对维持细胞存活和生长所必需的蛋白质编码的基因。
5. frameshift mutation  在基因编码区，核苷酸插入或缺失导致三联体密码子阅读方式的改变，从而使该基因的相应编码序列发生改变。 
6. DNA binding domainDNA结合域 
7.Shine-dalgarno sequence SD序列  SD序列是原核生物mRNA中5＇端富含嘌呤的短核苷酸序列,一般位于mRNA的起始密码AUG的上游3至11个核苷酸处,并且同16S rRNA 3＇端的序列互补。
8. gel retardation凝胶阻滞  该方法用来研究DNA与特异性蛋白的相互作用，通常是放射性标记的DNA片段与纯化蛋白，或提取物中的蛋白混合物相结合，然后在非变性凝胶中分析该产物。与游离DNA相比，蛋白-DNA复合物的迁移率将降低，因此，与游离DNA相对应，人们将观察到带中的“阻滞”。