表面抗原的变异和哺乳动物免疫多样性都是DNA重排的结果。锥虫通过DNA重 排选择表达所携带的一千多个不同的VSG基因中的一个。而哺乳动物细胞则通过 DNA重排产生成百上千个不同的抗体，包括与VSG蛋白反应的抗体，尽管抗体在 数量上的优势，锥虫仍然能够成功地逃避宿主的免疫系统，为什么? --类型：分析题

--答案： 答： 锥虫因为细胞分裂周期短而取胜。当锥虫感染哺乳动物时，它在血流中以快速的倍增时间复制。在感染开始后不久，识别锥虫VSG的B细胞从休眠状态被激活并开始膨大，而哺乳动物细胞的分裂比锥虫慢得多。当B细胞膨大到足以杀死锥虫时，一些锥虫的VSG已经发生了改变，使B细胞不再能识别它。这样就起始了新一轮的感染，直到免疫系统能识别它时就已改变成能逃得过免疫系统的变体，于是又开始了新的循环。






请解释酵母的交配型系统为什么可以作为DNA重组、染色质结构对基因表达的调控、染色体结构域的保持、转录元件间的蛋白互作、基因表达的细胞类型特异性以及信号传递激活基因的例子。 --类型：分析题

--答案： 答： 交配型体系通过DNA重排把交配型基因从沉默基因座(HMT和HML)转移到表达基因座(MAT)。沉默基因座由HMT和HML的染色体结构控制而没有转录活性。 E和I沉默子区域是产生不活动染色体结构的分界。一些转录因子的活性受到蛋白—蛋白相互作用的调节，如PRTF转录因子。PRTF能单独激活“α-特异基因，与α-蛋白结合时能激活。α-特异基因。当α2出现时，它抑制α-特异基因。细胞类型特异表达基因的表达以HO基因为例，它具有一个复杂的启动子，该启动子只在单倍体细胞中有活性，在双倍体细胞中没有活性。HO启动子还受到细胞周期的调节，它只在G1期的后期有活性。最后，交配型体系还采用一种信号传递级联作用来控制基因的表达。交配型外激素与细胞表面受体的结合激活了一系列将信号传递到核内并改变基因表达的蛋白激酶。






锥虫的表面抗原转变与酵母中的交配型转换有何相似之处?有何不同? --类型：分析题

--答案： 答：表面抗原的多样性和交配型的转变相似，因为每一系统在基因组的多基因座上具有等位基因，无论何时都只有一个基因座能表达。在两个系统中，当等位基因拷贝到表达基因座时就有活性。不活动的表面抗原基因座(多于100个)比不活动的交配型基因座(2个)多。另一个不同之处在于表面抗原表达的基因座位于端粒中，而表达的MAT基因座更靠近中心粒。最后，表面抗原基因的表达基因座可以改变；而交配型基因不能。


解释剂量补偿，在哺乳动物和果蝇中是怎样实现的? --类型：分析题

--答案： 答： 一个二倍体的两套染色体组成一个细微的平衡系统，若这个平衡因存在一个额外的常染色体或缺少一对同源常染色体中的一条染色体而被破坏时，将产生一个高度不正常的个体。但在胎盘哺乳类中，雌性常有两个X染色体然而雄性却是半杂合体，仅有1个X染色体，这就暗示存在一种机制可以补偿这种由基因剂量引起的差异。在哺乳动物中，这种不平衡因雌性体内的一条X染色体失活而恢复。这条X染色体变得高度螺旋，看起来像一个恰好位于核膜下的异染色质体(Barr小体)；．在这种情况下X染色体全部或部分地失活，因而不论雄性或雌性都仅有一条具活性的X染色体且有相同的遗传平衡，这个现象就是剂量补偿。X染色体失活似乎是在体细胞早期发育过程中随机发生的，因此在一些细胞中来源于父亲的X染色体失活，而在其他细胞中是来源于母亲的X染色体失活；而且，一旦发生了失活，所有子代细胞都有同样的失活X染色体。在黑腹果蝇中却发生了不同形式的剂量补偿。X染色体从不像哺乳动物那样浓缩成耳咀小体，但是雄性X染色体上某些基因的活性是雌性X染色体上相对应基因的活性的两倍。由此，对于大多数基因来说，两性都有相等的产物，而其他基因在雌性中的产物是雄性的两倍。说明：Barr小体也称为性染色质小体。

列举证明雌性哺乳动物中X染色体失活随机发生的证据。 --类型：分析题

--答案： 答： 体细胞发育过程中发生的X染色体随机失活暗示所有的雌性哺乳动物在遗传上都是嵌合体，也就是组织中的一部分细胞中父方X染色体有活性，而一部分则是母方的X染有活性。 (1)玳瑁猫就是证明这个假设的一个很好的证据。 对B（黑毛)和b(橙毛)基因是杂合的雌猫的毛由黑斑和橙斑混合组成。可能的解释是：黑斑和橙斑是由一些特定的组织块形成，而这些组织块是由携带B或携带b的X染色体随机失活的细胞组成的。 (2)在人的X染色体上有一个基因座编码葡萄糖-6-磷酸脱氢酶。正常的野生型等位基因编码一个具有完全活性的酶，而突变等位基因则编码失活的酶，可用血清学方法检测出这个突变体：从一个雌性的杂合个体中分离出成纤维细胞进行组织培养，这样就可以检测不同克隆中是否存在活性酶或变异的失活型酶。从这些成纤维细胞中长出的克隆一半产生有活性的酶，而剩下的产生无活性的变异体。从来没有在同一个克隆中找到两种蛋白质。这些结果只在以下情况下才会出现：①每个克隆中只有一条活性X染色体；②发育过程中发生了随机失活。






一个tRNA基因的启动子序列突变将会分别对(1)基因产物和(2)细胞或生物体 的表型有什么影响? --类型：简答题

--答案：1． 答： (1) 因为RNA聚合酶III的启动子位于基因内，这种启动子序列的变化，将会改变前体tRNA的核苷酸序列。 (2) 可能没有，因为tRNA基因是过剩的。






列举原核生物同真核生物转录的差异。 --类型：简答题

--答案： 答： 二者的差异列于表A11.1


--答案图片：picture--as11.1.jpg




增强子具有哪些特点? --类型：简答题

--答案： 答： (1)增强相邻启动子的转录； (2)两个方向都能起作用； (3)位于相邻启动子的上游或下游都能起作用； (4)在远距离外也能起作用； (5)具有细胞类型的特异性。






哪些转录因子含有TBP？为什么它们被称为定位因子？请用一个模型解释为什么所有三种RNA聚合酶都能与TBP发生作用? --类型：简答题

--答案： 答： TBP是聚合酶I因子SLl，聚合酶II因子TFIIID和聚合酶III因子TFIIIB的组成成分。所有这些蛋白都能帮助RNA聚合酶定位于起始位点的附近。 TBP可能与这三种RNA聚合酶都具有的一个亚基相互作用。






什么是转录起始前复合体? --类型：简答题

--答案： 答： 前起始复合体包含与RNA聚合酶相结合所必需的基本转录因子。






RNA聚合酶Ⅲ的内部启动子位于起始位点下游50个核苷酸的位置，它是如何被定 位并正确起始转录的? --类型：简答题

--答案： 答： TFIIIA和TFIIIC因子结合于聚合酶III的内部启动子上并吸引TFIIIB结合到起始位点上游的一个位点上，接着TFIIIB就将RNA聚合酶III定位到起始位点。






对带有内部启动子的RNA聚合酶Ⅱ基因有什么样的编码限制因素? --类型：简答题

--答案： 答： A、B、C盒必须能够被与之结合的聚合酶III的转录因子所识别。因此它们与共同序列不能相差太大。因为这些元件就位于聚合酶III转录物的编码区内所以它们限制了该区域内的转录物的编码能力。






当一段活性转录DNA受损时，模板首先被修复。请用一个模型解释这一现象。 --类型：简答题

--答案： 答： TFIIH以两种形式存在：激酶复合物和修复复合物。在转录起始之后，激酶形式被修复形式所代替。当遇到受损的DNA时，RNA聚合酶II活性下降。这可能成为激活TFIIH修复活性的信号。
真核生物中，基因的表达受不同水平的调控，请列举其中3种。 --类型：简答题

--答案： 答： 基因结构的激活，3’端的形成，转录过程，mRNA向细胞质的运输。






甾醇类转录因子与锌指蛋白类转录因子的区别是什么? --类型：简答题

--答案： 答： 类固醇受体与锌以Cys—Cys—Cys—Cys基序相结合，而锌指蛋白使用Cys—Cys-His—His基序。






亮氨酸拉链蛋白所识别的DNA有何特点?如何理解亮氨酸拉链转录因子的二聚体结构同识别位点的关系？ --类型：简答题

--答案： 答：亮氨酸拉链转录因子识别没有间隔的反向重复序列。亮氨酸拉链区将两个亚基连接在一起，使相邻的碱性区域以相反的极性首尾相连。






虽然同源异型蛋白与锌指蛋白差别很大，但是它们识别DNA序列的结构元件相似的，这个元件是什么？ --类型：简答题

--答案： 答：同源框蛋白和亮氨酸拉链转录因子通过位于大沟中的?—螺旋与DNA结合。






协同控制(coordinate control)下的基因是如何被同时激活的? --类型：简答题

--答案： 答： 协同控制下的基因在它们的启动子上都具有一个相同的反应元件。当正确的转录因子被激活时，所有具有这一反应元件的基因都被激活。






列出调控转录因子被激活的7种途径，并各举一例。 --类型：简答题

--答案： 答： 蛋白的合成(同源异型区)，磷酸化作用(HSTF)，去磷酸化作用(AP—1)，配体结合／核定位(类固醇受体)，活化因子的释放(甾醇)，与抑制剂脱离(NF??B)。






许多转录因子是细胞原癌基因的产物，为什么突变的转录因子可能导致癌变? --类型：简答题

--答案： 答： 突变的转录因子可能不正确地激活促使细胞分裂的基因。






转录因子能够与装配成核小体的DNA序列结合吗? --类型：简答题

--答案： 答： 一些转录因子能够结合核小体覆盖的DNA，有一些则不能。如TF IIIA不能结合核小体覆盖的DNA而糖皮质激素受体能够结合。






有两个模型可以解释染色质中的基因是如何被转录的。优先模型(preemptive mode1)中，转录因子和RNA聚合酶是如何与启动子结合的?为什么在动态模型中需要ATP? --类型：简答题

--答案： 答：在优先模型中，只有在DNA复制时转录因子与核小体才能互相代替。复制时转录因子能稳定地与DNA相结合以支持转录。在动态模型中，组蛋白被一种能使转录因子与DNA相结合的ATP依赖型因子所代替。






为什么酵母SWI与SNF基因的突变会影响不同靶基因的转录? --类型：简答题

--答案： 答： SW1SNF3基因来源于一个大的复合物，它们通过移动或者去除核小体重新“改造”染色质而使转录因子能激活多个基因。


一般认为，染色体中具有多个调控基因表达的结构域。每个结构域中可以找到哪些功能位点，它们的作用如何? --类型：简答题

--答案： 答：结构域之间以绝缘体为界，它把一个个的结构域分离开来。结构域可能包含一个MAR(基质附着区域matrix attachment region)，它连接结构域与基质。最后，结构域也可能具有一个基因座控制区（locus control region，LCR)，该区域具有DNase I敏感位点，它作为整个结构域的增强子。






MyoD是一种bHLH蛋白，对肌肉细胞的发育很重要，它的活性是如何被调控的? --类型：简答题

--答案： 答： MyoD是只在肌肉细胞中表达的bHLH蛋白。 MyoD很少形成同源二聚体，但它能通过与bHLH蛋白E12或E47形成异源二聚体而被激活。 MyoD的活性受到HLH蛋白Id的控制。Id与E12和E47形成不能与DNA结合的异源二聚体，由于Id夺去了MyoD形成异源聚体的E12和E47蛋白，从而阻止了MyoD的活性。






酵母U6sRNA基因有一个TATA盒位于上游，在基因内有一个弱的A盒，基因下游的远端还有一个保守的B盒。体外实验时，RNA聚合酶Ⅱ和Ⅲ都可以转录这个基因，但体内实验发现只有RNA聚合酶Ⅲ可以转录它。如何确定该基因启动子的聚合酶特异性? --类型：简答题

--答案： 答： A盒和B盒结合TF IIIC，TF III C能够吸引TF IIIB。TF IIIB中的TBP与TATA盒的相互作用帮助TF IIIB稳定结合于上游区域。如果A、B盒位于正确的位置并能很好地互相匹配那就不需要TATA盒了。






举例说明单链核酸中形成茎环结构的重要性。 --类型：简答题

--答案： 答： 单链核酸形成的茎环结构是固有的转录终止子，例如RNA中的茎环结构。






用负超螺旋环状DNA样品进行体外转录实验。但是预实验中并没有获得满意的结果，试讨论改进实验的可行方法。 --类型：简答题

--答案： 答： 由于DNA是高度卷曲所以不能有效转录，改进的办法是加入DNA促旋酶，可以去除负超螺旋，使DNA处于松弛状态，就可以进行转录实验。






组蛋白H2A基因在所有细胞中都进行表达，而免疫球蛋白基因只在淋巴样细胞中表达。两类基因的启动子都含有转录因子0ct-l的结合位点，0ct-1也存在于这两 类细胞中，但为什么免疫球蛋白只在淋巴样细胞中表达? --类型：简答题

--答案： 答： 免疫球蛋白基因的表达需要只在淋巴细胞中具有的Oct—2或其他的转录因子，而单独一个转录因子往往不足以活化基因，同时必须考虑整个启动子。只有DNA重排在启动子的作用范围内产生一个下游增强子之后，免疫球蛋白才能被完全激活。






RNA聚合酶Ⅱ起始转录后，起始复合物必须转变为延伸复合物。因此聚合酶复合物必须解旋一小段DNA。在线性DNA上，解旋需要ATP，TFⅡE，TFⅡH和解旋酶活性。然而，超螺旋DNA的转录并不需要这些因子。请解释这一现象。 --类型：简答题

--答案： 答： 对于线性DNA，TF IIE、TFIIH和ATP是聚合酶II复合体前方的DNA解旋所必需的。这些因子并不是超螺旋DNA转录所必需的，因为它们只在负超螺旋的解旋中活性较高。






RNA聚合酶Ⅲ特异性地转录小分子RNA，但为什么不转录5.8SrRNA? --类型：简答题

--答案： 答： 5.8SrRNA是作为前体RNA大分子的一部分被转录的 。






在RNA聚合酶的分析中，3H—UTP作为标记的核苷酸，它的比活性是500μCi/μmol(1μCi=2.2×106计数／分钟)。温育10分钟之后，经三氯乙酸沉淀，用对3H效率为60％的液闪计数器测得放射性强度为692521计数／每分钟。 (1) 请计算掺入到RNA分子中UTP的量(nmol)。 (2) 假定RNA分子中的尿嘧啶占30％，请计算RNA分子中掺入核苷酸总的纳摩尔数。 (3) 如果DNA模板改用poly(dGdC)，?UTP是否可以掺入? (4) 如果新合成的RNA分子的核苷酸组成是：20％的C；32％的G,30％的U和18％ 的A，写出转录的DNA链及双链DNA的核苷酸组成的百分比。 --类型：分析题

--答案： 答： (1)掺入3H—UTP的Bq=692521×100/60=19236.7 掺入的μCi＝19236.7×60／2200000=0.525 1μCi＝1／500μmol 因此0.525μCi =0.525／500＝1.05×0.001μmol＝1.05nmol； (2)1.05×100/30＝3.5 (3)不可以。 （4）转录链： C 32％； T18％； A30％； G 20％； 非转录链： G 32％； A18％； T30％； C20％； 双链DNA： G26％； A 24％； C 26％； T24％。






TFA是5SRNA基因表达所需的转录因子，这个蛋白含有9个锌指结构域，与5SrRNA基因内的一段序列和5SrRNA本身结合。 (1)如何定位TFⅢA蛋白的DNA结合位点? (2)什么样的突变可以证明锌指是DNA结合所需的? (3)有人发现TFⅢAC端缺失19个氨基酸后与DNA结合的能力与野生型一样，但是不能激活5SrRNA基因的转录，请解释原因。 （4）Xenopus的卵母细胞中合成并贮存了大量的5SrRNA，随着5SrRNA的积累， TFⅢA与之结合，这对5SrRNA基因的转录有何影响?调控这个过程的机制是什么? --类型：分析题

--答案： 答： （1)分离一个带有5SrRNA基因的限制性片段。用多核苷酸激酶标记两个5’末端，用限制性内切酶切割其中一个标记末端。用纯化过的TF IIIA结合于DNA上，然后用DNase I处理，在胶上分析切割产物，蛋白质结合的位置就是DNA上没有被消化的区域。实验中需要设置一个不加蛋白质的对照，并且要滴定DNaseI的浓度。 (2)能使锌结合能力丧失的残基突变体。 (3)这些氨基酸的缺失并不影响DNA结合结构域。请思考转录因子还有哪些其他的结构域?这些结构域可能与其他什么蛋白起作用就可以知道原因了。 （4）TFIIIA调节爪瞻卵母细胞中5S rRNA的积累，因为它既能结合5S rRNA基因又能结合5SrRNA。当只有少量的5SrRNA存在时，大部分的TF IIIA与DNA结合并激活了5SrRNA基因的转录。随着5SrRNA水平的上升，TF IIIA与5SrRNA结合而丧失转录活性，这就是个反馈调节。
为什么被RNA聚合酶Ⅲ识别的启动子不常见? --类型：分析题

--答案： 答： RNA聚合酶III负责转录一类具有以下特征的基因： (1)转录物长度少于3.00个核苷酸； (2)转录物不编码蛋白质 ； (3)基因通常以多拷贝存在。 这类基因包括5SrRNA和tRNA基因。 与其他基因的启动子不同，这类基因的启动子位于基因的内部，它是在研究一种5SrRNA的基因5’端的序列时首次发现的。该基因的前50对核苷酸完全缺失对转录起始毫无影响；同样地，十84以后序列的缺失对转录起始也没有影响。因此，十50到十84间的序列为5S rRNA基因的启动子。更少见的是，tRNA基因的启动子被分成A和B两部分，它们之间的序列缺失不影响启动子的效率。






什么是增强子?它们与其他调控序列有何不同? --类型：分析题

--答案： 答： 增强子指可以增强邻近结构基因转录的序列。结合一种特异性蛋白后，它们被激活，然后(猜测如此)作为转录起始复合物聚合的位点。它们与其他大多数调控序列有以下不同： (1)可以与所调控转录的基因距离几千碱基； (2)可位于基因的上游或下游； (3)作用时无方向性，因而能同时影响两侧两个基因的表达； (4)必须与受调控的基因位于同一DNA分子中，但可位于任一条DNA链上； (5)没有基因特异性，增强子可激活两侧的任一基因； (6)有组织特异性。因而，免疫球蛋白基因的增强子只能促进免疫系统细胞中邻近基因的转录； (7)优先作用于最邻近启动子的转录； (8)与增强子结合的蛋白包括激素受体蛋白；因而，发育过程中增强子可能在基因活性的调控中起重要作用 。






在酵母中，上游激活序列是如何调控半乳糖基因的表达? --类型：简答题

--答案： 答：在酵母中有三个协同调节的基因，它们的产物催化半乳糖向6—磷酸—葡萄糖转变反应中的连续步骤。虽然这些，基因紧密连锁，但它们却是分别转录的。在这个体系(图A11.1)中有两个上游激活序列(UAS)，一个位于gal1和gal10之间的区域内，此区域内还含有这些基因的启动子序列，另一个UAS与gal7的启动子毗邻。有两个不连锁的调节基因：促进gal基因转录的正调控基因和编码阻遏蛋白的负调控基因，其中正调控基因产生与两个UAS结合的激活蛋白。缺乏半乳糖时，转录不被激活，可能由于阻遏蛋白与激活蛋白结合；如果存在乳糖，则它可以与阻遏蛋白相互作用，破坏其抑制激活蛋白的能力。说明… 1) gal1 、 gal7、gal10分别编码半乳糖激酶，半乳糖转移酶和半乳糖差向异构酶。 2) 如果酵母的其他任一基因置于UAS附近，那么它的活性就由半乳糖的存在与否来控制。


--答案图片：picture--a11.1.jpg




（ ）可使每个氨基酸和它相对应的tRNA分子相偶联形成一个( )分子 --类型：填空题

--答案： 氨酰tRNA合成酶，氨酰tRNA






（ ）包括两个tRNA分子的结合位点：( )即P位点，紧密结合与多肽链延伸尾端连接的tRNA分子，和( ),即A位点，结合带有一个氨基酸的tRNA分子。 --类型：填空题

--答案： 核糖体，肽酰tRNA结合区，氨酰tRNA结合区






( )催化肽键的形成，一般认为这个摧化反应是由核糖体大亚基上的( )分子介导的。 --类型：填空题

--答案： 肽酰转移酶，rRNA






释放因子蛋白与核糖体上A位点的( )密码结合，导致肽基转移酶水解连接新生多肽tRNA分子的化学键。 --类型：填空题

--答案： 终止






任何mRNA序列能以三种（ ）的形式被翻译，而且每一种都对应一种完全不同的多肽链。 --类型：填空题

--答案： 可读框






蛋白质合成的起始过程很复杂，包括一系列被（ ）催化的步骤。 --类型：填空题

--答案： 起始因子






在所有细胞中，都有一种特别的（ ）识别（ ）密码子AUG，它携带一种特别的氨基酸即（ ），作为蛋白质合成的起始氨基酸。 --类型：填空题

--答案： 起始tRNA， 起始， 甲硫氨酸

核糖体沿着mRNA前进，它需要另一个延伸因子（ ），这一步需要（ ）的水解。当核糖体遇到终止密码（ ）、（ ）、（ ）的时候，延长作用结束，核糖体和新合成的多肽被释放出来。翻译的最后一步被称为（ ），并且需要一套（ ）因子。 --类型：填空题

--答案： EF—G；GTP；UAG；UGA；UAA；终止； 释放






氨酰tRNA分子同核糖体结合需要下列哪些蛋白因子参与？( ) --类型：选择题 --选择： (a) EF-G (b) EF-Tu (C) EF-Ts (d)eIF-2 (e)EF-1

--答案：b，d，e ；






在真核生物细胞中，翻译的哪一个阶段需要GTP?( ) --类型：选择题 --选择：(a)加RNA的5’末端区的二级结构解旋 (b)起始tRNA同核糖体的结合 (c)在延伸的过程中，tRNA同核糖体的结合 (d)核糖体的解体 (e)5’帽子结构的识别

--答案：b，c；






下列关于原核生物转录的叙述中哪一项（那一些)是正确的？( ) --类型：选择题 --选择：(a)核糖体的小亚基能直接同mRNA作用 (b)IF-2与含GDP的复合物中的起始tRNA结合 (c)细菌蛋白质的合成不需要ATP (d)细菌所有蛋白质的第一个氨基酸是修饰过的甲硫氨酸 (e)多肽链的第一个肽键的合成不需要EF-G

--答案： a，d，e；






下面关于真核生物翻译的叙述中，哪一个（一些)是正确的？( ) --类型：选择题 --选择：（a）起始因子eIF只有同GTP形成复合物才起作用 (b)终止密码子与细菌的不同 (c)白喉毒素使EF-1 ADP核糖酰化 (d)真核生物蛋白质的第一个氨基酸是修饰过的甲硫氨酸，在蛋白质合成完成之后，它马上被切除， (e)真核生物的核糖体含有两个tRNA分子的结合位点

--答案： a，e；






下列叙述不正确的是：( ) --类型：选择题 --选择：（a）共有20个不同的密码于代表遗传密码（b)色氨酸和甲硫氨酸都只有一个密码子（c）每个核苷酸三联体编码一个氨基酸 (d)不同的密码子可能编码同一个氨基酸 (e)密码子的第三位具有可变性