王镜岩2011考研生物化学(内部资料)(3)
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(6)、 二磷脂酰甘油(心磷脂)
2、 甘油磷脂的性质
①极性:极性头、非极性尾
②带电性(可用于分离纯化)
图
二、 鞘磷脂
高等动物组织中含量较丰富。
1、 组成:
一个鞘氨醇 一个脂肪酸 一个磷酸 一个胆碱或乙醇胺
2、 结构与性质
鞘磷脂极性头部分是磷脂酰胆碱或磷脂酰乙醇胺。
鞘磷脂结构与甘油磷脂相似,因此性质与甘油磷脂基本相同。
第四节 鞘脂类
鞘脂类也是动植物生物膜的重要组分。
鞘脂类含有一个长的氨基醇。
一、 鞘氨醇
已发现的鞘氨醇类约有30种。
图 2-氨基-4-十八碳烯-1.3-二醇
此双键还原,即二氢鞘氨醇
鞘氨醇 植物鞘氨醇
二、 神经酰胺
鞘脂类的核心结构是神经酰胺(ceramide),由鞘氨醇氨基以酰胺键与长链(18—26C)脂肪酸的羟基相连。
图 神经酰胺
在鞘磷脂中,神经酰胺1位的-OH被磷酸胆碱(phosphorylcholine)或磷酸乙醇胺(phosphorylethanolamine)的磷酸基因酯化。
除了动物细胞膜外,鞘磷脂在神经细胞的髓鞘中含量最丰富。
第五节 结合脂类
一、 糖脂 glycolipid
P478 图9—8 P479 图9—10
甘油醇糖脂 N—脂酰神经鞘氨醇糖脂(神经酰胺糖脂)
1、 甘油醇糖脂
图
半乳糖甘油二酯 称:6—磺基Glc甘油二酯
2、 N—脂酰神经鞘氨醇糖脂(神经酰胺糖脂)
神经酰胺还是糖脂的前体物,有时称鞘糖脂。
图9.9
在鞘糖脂中,单糖、双糖或寡糖通过O-糖苷键与神经酰胺相连,重要的鞘糖脂有脑苷脂(cerebroside)、硫脑苷脂(sulfatide)和神经节苷脂(ganglioside)。
脑苷脂是单糖与神经酰胺形成的糖脂,是非离子型的。半乳糖脑苷脂(galatocerebroside)几乎全部存在于脑的细胞膜中。
脑苷脂被硫酸化后称为硫脑苷脂,在生理pH下带负电荷。
寡糖链(带有一个或多个唾液酸残基)与神经酰胺形成的鞘糖脂称为神经节苷脂,最初是从神经组织中分离到的,在其它组织中也有分布。
神经节苷脂的命名含有M、D、T和角注数字,M、D、T分别表示含有一个、两个、三个唾液酸,数字表示在糖链上的位置。
(1)、 脑苷脂(中性糖鞘脂类)
图
主要在神经、脑组织中,X为Glc称Glc脑苷脂,X为Gal称Gal脑苷脂。X还可能是:Fuc、GlcNAc、GalNAc
(2)、 神经节苷酯(酸性糖鞘脂类)
含有唾液酸,在脑灰质和胸腺中含量高。
中枢神经系统某些神经元膜的特征性脂,可能与通过神经元的神经冲动传递有关。
图
人的神经系统细胞膜至少有15种神经节苷脂,它们的生物功能尚未完全了解。
3、 糖脂的生物学功能
糖脂的功能还不十分清楚,有些动物细胞膜上的糖脂分子能与细菌毒素以及细菌细胞结合,起受体的作用。
(1)细胞结构的刚性
(2)抗原的化学标记 血型抗原
图
人的A、B、O血型差异在于糖链末端残基。现在临床上正研究用酶促降解B—抗原或A抗原的末端残基Gal或GalNAc,从而增加O—抗原的血液来源。
(3)细胞分化阶段可鉴定的化学标记
可能与糖链的长短有关
(4)调节细胞的正常生长
与正常细胞转化成肿癌细胞有关。肿癌Cell的神经节苷脂糖链比正常Cell的短。
(5)授予细胞与其它生物活性物质的反应性倾向。
鞘脂贮积病(sphingolipld storage disease, sphingolipidose)
-氨基己糖苷酶)缺陷造成的。当细胞积累GM2时就溶胀最终死亡,Tay-Sachs综合症(失明,肌肉萎缩,抽搐,精神错乱),通常在出生数月后表现出来。-hexosaminidaseA(溶酶体贮积病是由于降解某种特定代谢物的酶发生遗传性缺陷造成的。一些溶解体贮积病与鞘脂代谢有关,也称鞘脂贮积病,常见的就是Tay-sochs神经节苷GM2贮积病,这是由于降解它的
disease symptern Accumulating spluingolipid Enzyme deficiency
Tay-sachs disease Blindness
Muscle weakness
Seizures
Mental retardation Ganglioside -hexosaminidoseAGM2
Gaucheris disease Mental retardations,
Liver and spleen enlargement
Eresion of cong -glucosidasebones Glucocerebosile
Niemann-Pick disease Montal retardution sphingomyelin sphingomylinase
二、 脂蛋白 lipoprotein
要点:血桨脂蛋白 血桨白蛋白
(学生自己看,此处不讲,在脂代谢中讲。)
虽然脂蛋白可以指任何与脂基(如脂肪酸、异戊二烯)共价相连的蛋白、但它常常用来指哺乳动物血浆(尤其是人)中的脂-蛋白质复合物。
血浆脂蛋白可以把脂类(三酰甘油、磷脂、胆固醇)从一个器官运输到另一个器官。
图9.17 P233
血浆脂蛋白根据密度来分类:
(1) 乳糜微粒,密度非常低,运输甘油三酯和胆固醇脂,从小肠到组织肌肉和adipose组织。
(2) 极低密度脂蛋白VLDL(0.95-1.006g/cm3),在肝脏中生成,将脂类运输到组织中,当VLDL被运输到全身组织时,被分解为三酰甘油、脱辅基蛋白和磷脂,最后,VLDL被转变为低密度脂蛋白。
(3) 低密度脂蛋白(LDL,1.006-1.063g/cm3),把胆固醇运输到组织,经过一系列复杂的过程,LDL与LDL受体结合并被细胞吞食。
(4) 高密度脂蛋白(HDL,1.063-1.210g/cm3),也是在肝脏中生成,可能负责清除细胞膜上过量的胆固醇。当血浆中的卵磷脂:胆固醇酰基转移酶(Lecithin cholesterol acyltransferase, LCAT)将卵磷脂上的脂肪酸残基转移到胆固醇上生成胆固醇脂时,HDL将这些胆固醇脂动输到肝。肝脏将过量的胆固醇转化为胆汁酸。
脂蛋白与动脉粥样硬化:(atherosclerosis)
动脉粥样硬化是一个慢性病,在此过程中,粥样物质逐渐沉积在动脉的内壁上,这些沉积物称为Plaque(蚀斑),在plaque形成过程中,平滑肌细胞、巨噬细胞和各种细胞残渣逐渐聚集。当巨噬细胞中吞食了大量脂类物质(主要是胆固醇和胆固醇脂)它们就成为粥样化细胞。最后,粥样硬化斑钙化(calcify)突入动脉腔,阻止血液流动,大脑、心、肺等器官就会缺氧和营养。冠状动脉粥样硬化病是最常见的一种,由于缺氧和营破坏了心肌。
Plaque中的胆固醇大部分是来自粥样细胞吞噬的LDL。因此,毫不奇怪,高水平的血浆LDL与冠状动脉粥样症直接相关(LDL含有大量的胆固醇及胆固醇脂),其它相关因素还包括高脂类饮食、吸烟、抑郁和缺少运动,高水平的血浆HDL与代几率的冠状动脉病有关。肝细胞是唯一具有HDL受体的细胞。
可粥样化的细胞具有LDL受体,当LDL与受体结合后这些细胞就通过胞吞作用吞食LDL。在正常情况下,进入细胞中的LDL释放出的胆固醇和其它脂类可用于细胞结构和代谢上的需要。通常情况下LDL受体功能是高度调控的,吞入相对大量的LDL后,LDL受体合成就降低。巨噬细胞却不同,LDL受体的合成并不降低,粥样硬化斑中的巨噬细胞含有高水平的LDL受体,而且对氧化破坏的LDL仍有亲和力。抗坏血酸(Vc)和VE都是抗氧化剂,能抑止粥样斑的形成。
第六节 萜类和固醇类化合物
可以统称为类异戊二烯类(isoprenoid),由乙酰-CoA经由异戊二烯焦磷酸生成的,而不是由异戊二烯合成的
一、 萜类
一些真核蛋白质合成后经过异戊二烯化,常见的异戊二烯基团就是farnesyl和geranylgeranyl group
二、 固醇类
结构:
含有环戊烷多氢菲母核的一类醇、酸及其衍生物。包括:固醇、固醇衍生物。
图
1、 胆固醇(二氢胆固醇、T—脱氢胆酸、胆固醇酯)
以游离或酯的形态存在于一切动物组织中,植物中没有。是最早由从动物胆石中分离出的固醇。
(1)、 结构
C3 羟基
C10和C13各一个甲基
C5与C6间一个双键
C17异辛烷
(2)、 性质
白色、斜方晶体。
a. 醇基可与脂酸成酯(棕榈酸、硬脂酸、油酸)
b. 双键可加氢
(3)、 分布及功能
a. 70千克人体含140克左右,1/4在脑及神经组织中,肝、肾含量较多。肾上腺、卵巢等合成固醇激素的腺体含量也较多,可达1—5%。血清中含量升高,会增加患心血管疾病的可能性。
b. 胆固醇是生物膜的重要成分,羟基极性端分布于膜的亲水界面,母核及侧链深入膜双层,控制膜的流动性,阻止磷脂在相变温度以下时转变成结晶状态,保证膜在低温时的流动性及正常功能。
c. 胆固醇是合成胆汁酸、类固醇激素、维生素D等生理活性物质的前体。
胆汁酸(在肝中合成)参与肠道脂类吸收
肾上腺皮质激素、雌激素、雄激素
7一脱氢胆固醇 紫外线 维生素D3
2、 植物固醇
不能被动物吸收和利用。
主要有:豆固醇(大豆中)
麦固醇(麦芽中)
3、 酵母固醇
麦角固醇,经紫外光照射可转化成维生素D3。
三、 固醇衍生物
1、 胆汁酸
图
多数脊椎动物的胆酸,能以肽键与Gly或牛磺酸结合。胆酸与脂肪酸或其他脂类结合(胆固醇,胡萝卜素)成盐,乳化肠腔内油脂,增加脂肪酶作用位点,便于油脂消化吸收。
2、 类固醇激素
(1)肾上腺皮质激素(7种)
(2)性激素
雄性激素:睾丸酮
雌性激素:雌二醇、、黄体酮
第七节 蜡脂生 物 类
酶是一类具有高效率、高度专一性、活性可调节的高分子生物催化剂。
1957巴斯德提出酒精发酵是酵母细胞活动的结果。
1 分子Glc→2分子乙醇+2分子CO2 从Glc开始,经过12种酶催化,12步反应,生成乙醇。
1897 Buchner兄弟证明发酵与细胞的活动无关,不含细胞的酵母汁也能进行乙醇发酵。
1913 Michaelis和Menten提出米氏学说—酶促动力学原理。
1926 Sumner首次从刀豆中提出脲酶结晶,并证明具有蛋白质性质。
1969 化学合成核糖核酸酶。
1967-1970 从E.coli中发现第I、第II类限制性核酸内切酶。
1986 Cech发现四膜虫细胞大核期间26S rRNA前体具有自我剪接功能。
ribozyme , deoxyribozyme
E.coRI
5’——GAATTC——3’
3’——CTTAAG——5’
限制作用 修饰作用
5’——GAATTC——3’ 5’——GAATTC——3’
3’——CTTAAG——5’ 3’——CTTAAG——5’
第一节 酶学概论
一、 酶的生物学意义
大肠杆菌生命周期20分钟,生物体内化学反应变得容易和迅速进行的根本原因是体内普通存在生物催化剂—酶。没有酶,生长、发育、运动等等生命活动就无法继续。
限制性核酸内切酶(限制-修饰)
二、 酶的概念及其作用特点
1、 酶是一种生物催化剂
酶是一类具有高效率、高度专一性、活性可调节的高分子生物催化剂。
生物催化剂 :酶(enzyme),核(糖)酶(ribozyme),脱氧核(糖)酶(deoxyribozyme)
2、 酶催化反应的特点
(1)、 催化效率高
酶催化反应速度是相应的无催化反应的108-1020倍,并且至少高出非酶催化反应速度几个数量级。
(2)、 专一性高
酶对反应的底物和产物都有极高的专一性,几乎没有副反应发生。
(3)、 反应条件温和
温度低于100℃,正常大气压,中性pH环境。
(4)、 活性可调节
根据据生物体的需要,许多酶的活性可受多种调节机制的灵活调节,包括:别构调节、酶的共价修饰、酶的合成、活化与降解等。
(5)、 酶的催化活性离不开辅酶、辅基、金属离子
3、 酶与非生物催化剂相比的几点共性:
①催化效率高,用量少(细胞中含量低)。
②不改变化学反应平衡点。
③降低反应活化能。
P234 图4-1 非催化过程及催化过程自由能的变化
④反应前后自身结构不变。
催化剂改变了化学反应的途径,使反应通过一条活化能比原途径低的途径进行,催化剂的效应只反映在动力学上(反应速度),不影响反应的热力学(化学平衡)。
三、 酶的化学本质
(一) 酶的蛋白质本质
经典概念:所有的酶都是蛋白质,酶是具有催化功能的蛋白质,因此酶具有蛋白质的一切共性。
1、 酶的蛋白质组成
有些酶仅由蛋白质组成,例如,脲酶、溶菌酶、淀粉酶、脂肪酶、核糖核酸酶等
有些酶不仅含有蛋白质(酶蛋白),还含有非蛋白质成分(辅助因子),只有酶蛋白与辅助因子结合形成复合物(全酶)才表现出酶活性,如超氧化物歧化酶Cu2+、Zn2+)、乳酸脱氢酶(NAD+)
酶的专一性由酶蛋白的结构决定,辅助因子传递电子或某些化学基团。
2、 酶的辅助因子
酶的辅助因子主要有金属离子(Fe2+、Fe3+ 、Cu+、Cu2+、 Mn2+、、Mn3+、Zn2+、Mg2+ 、K+、 Na+ 、Mo6+ 、Co2+等)和有机化合物。
辅酶:与酶蛋白结合较松,可透析除去。
辅基:与酶蛋白结合较紧。
酶 辅助因子
CuZn-SOD Cu2+ Zn2+
Mn-SOD Mn2+
过氧化物酶 Fe2+或Fe3+
II型限制性核酸内切酶 Mg2+
羧肽酶 Zn2+
P235 表4-1 一些酶的辅助因子(金属离子)
P237 表4-2 基团反应中的辅酶和辅基。
酶蛋白决定酶专一性,辅助因子决定酶促反应的类型和反应的性质。比如,NAD+可与多种酶蛋白结合,构成专一性强的乳酸脱氢酶、醇脱氢酶、苹果酸脱氢酶、异柠檬酸脱氢酶。
生物体内酶种类很多,而辅助因子种类却很少,原因是一种辅助因子可与多种酶蛋白结合。
(二) ribozyme核酶(具有催化功能的RNA)
1980以前,已知所有的生物催化剂,其化学本质都是蛋白质。
80年代初,美国科罗拉多大学博尔德分校的Thomas Cech和美国耶鲁大学Sidney Altman各自独立发现RNA具有生物催化功能,此发现被认为是近十年生化领域最令人鼓舞的发现,此二人分亨1989诺贝尔化学奖。
ribozyme种类:①自我剪接ribozyme ②自我剪切ribozyme ③催化分子间反应ribozyme
后边细讲
四、 按酶蛋白的亚基组成及结构特点分类
1、 单体酶
由一条或多条共价相连的肽链组成的酶分子
牛胰RNase 124a.a 单链
鸡卵清溶菌酶 129a.a 单链
胰凝乳蛋白酶 三条肽链
单体酶种类较少,一般多催化水解反应。
2、 寡聚酶
由两个或两个以上亚基组成的酶,亚基可以相同或不同,一般是偶数,亚基间以非共价键结合。
①含相同亚基的寡聚酶
苹果脱胱氢酶(鼠肝),2个相同的亚基
②含不同亚基的寡聚酶
琥珀酸脱氢酶(牛心),αβ2个亚基
寡聚酶中亚基的聚合,有的与酶的专一性有关,有的与酶活性中心形成有关,有的与酶的调节性能有关。
大多数寡聚酶是胞内酶,而胞外酶一般是单体酶。
3、 多酶复合体
由两个或两个以上的酶,靠非共价键结合而成,其中每一个酶催化一个反应,所有反应依次进行,构成一个代谢途径或代谢途径的一部分。如脂肪酸合成酶复合体。
例如:大肠杆菌丙酮酸脱氢酶复合体由三种酶组成
①丙酮酸脱氢酶(E1) 以二聚体存在2×9600
②二氢硫辛酸转乙酰基酶(E2) 70000
③二氢硫辛酸脱氢酶(E3) 以二聚体存在2×56000
复合体:12个E1二聚体 24×96000
24个E2单体 24×70000
6个E3二聚体 12×56000
总分子量560万
4、 多酶融合体
一条多肽链上含有两种或两种以上催化活性的酶,这往往是基因融合的产物。
例如:天冬氨酸激酶I---高丝氨酸脱氢酶I融合体(双头酶)
该酶是四聚体α4,每条肽链含两个活性区域:N-端区域是Asp激酶,C端区域是高Ser脱氢酶。
五、 酶在细胞中的分布
一个细胞内含有上千种酶,互相有关的酶往往组成一个酶体系,分布于特定的细胞组分中,因此某些调节因子可以比较特异地影响某细胞组分中的酶活性,而不使其它组分中的酶受影响。
1. 分布于细胞核的酶
核被膜 酸性磷酸酶
染色质 三磷酸核苷酶
核仁 核糖核酸酶
核内可溶性部分 酵解酶系、乳酸脱氢酶
2. 分布于细胞质的酶
参与糖代谢的酶 酵解酶系
磷酸戊糖途径酶系
参与脂代谢的酶 脂肪酸合成酶复合体
参与a.a蛋白质的酶 Asp氨基转移酶
参与核酸合成的酶 核苷激酶 核苷酸激酶
3. 分布于内质网的酶
光滑内质网 胆固醇合成酶系
粗糙内质网 蛋白质合成酶系
(细胞质一侧)
4. 分布于线粒体的酶
外膜:酰基辅酶A合成酶
内膜:NADH脱氢酶
基质:三羧酸循环酶系
脂肪酸β-氧化酶系
5. 分布于溶酶体的酶
水解蛋白质的酶
水解糖苷类的酶
水解核酸的酶
水解脂类的酶
6. 标志酶
有些酶只分布于细胞内某种特定的组分中,
核: 尼克酰胺单核苷酸腺苷酰转移酶,功能:DNA、RNA生物合成
线粒体:琥珀酸脱氢酶(电子转移、三羧酸循环)
溶酶体:酸性磷酸酶(细胞成分的水解)
微粒体:(核蛋白体、多核蛋白体、内质网)Glc-6-磷酸酶
上清液:乳酸脱氢酶
第二节 酶的国际分类及命名
一、 习惯命名
1961年6以前使用的酶沿用习惯命名
1.(绝大多数酶)依据底物来命名
如:催化蛋白质水解的酶称蛋白酶。催化淀粉水解的酶称淀粉酶。
2. 依据催化反应的性质命名
如:水解酶、转氨酶
3 结合上述两个原则命名,琥珀酸脱氢酶。
4. 有时加上酶的来源
如:胃蛋白酶、牛胰凝乳蛋白酶
习惯命名较简单,但缺乏系统性。
二、 国际系统命名
系统名称应明确标明酶的底物及催化反应的性质。
如:草酸氧化酶(习惯名),系统名称: 草酸:氧氧化酶
又如:谷丙转氨酶(习惯名),系统名: 丙氨酸:α-酮戊二酸氨基转移酶
反应:丙氨酸+α--酮戊二酸→Glu+丙酮酸
三、 国际系统分类法及编号(EC编号)
原则:将所有酶促反应按性质分为六类,分别用1、2、3、4、5、6表示。
再根据底物中被作用的基团或键的特点,将每一大类分为若干个亚类,编号用1、2、3……,每个亚类又可分为若干个亚一亚类,用编号1、2、3……表示。
每一个酶的编号由4个数字组成,中间以“•”隔开。第一个数字表示大类,第二个数字表示亚类,第三个表示亚-亚类,第四个数字表示在亚-亚中的编号。
1、 氧化还原酶类
催化氧化还原反应: A•2H+B=A+B•2H
乳酸:NAD+氧化还原酶(EC1.1.1.27), 习惯名:乳酸脱氢酶
图
2、 转移酶类
AB+C=A+BC
Ala:酮戊二酸氨基移换酶(EC2.6.1.2), 习惯名: 谷丙转氨酶
图
3、 水解酶类
催化水解反应,包括淀粉酶、核酸酶、蛋白酶、脂酶。
亮氨酸氨基肽水解酶(EC3.4.1.1), 习惯名: Ile氨肽酶。
4、 裂合酶类(裂解酶)
催化从底物上移去一个基团而形成双键的反应或其逆反应
二磷酸酮糖裂合酶(EC4.1.2.7), 习惯名:醛缩酶
5、 异构酶(EC5.3.1.9)
催化同分异构体相互转化,6-磷酸Glc异构酶
6、 合成酶(连接酶)
催化一切必须与ATP分解相偶联、并由两种物质合成一种物质的反应。
P241 表4-8 酶的国际分类——大类和亚类
举例:乙醇脱氢酶的分类编号是 EC1.1.1.1 ,乳酸脱氢酶EC1.1.1.27 , 苹果酸脱氢酶EC1.1.1.37
第一个数字表示大类: 氧化还原
第二个数字表示反应基团:醇基
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中国农业大学生物化学习题集 第一章 蛋白质化学 一、单项选择题 1.测得某一蛋白质样品的氮含量为0.40g,此样品约含蛋白质多少? A.2.00g B.2.50g C.6.40g D.3.00g E.6.25g 2.下列含有两个羧基的氨基酸是: A.精氨酸 B.赖氨酸 C.甘氨酸 D.色氨酸 E.谷氨酸 3.维持蛋白质二级结构 ...专业课考研资料 本站小编 免费考研网 2019-03-13中科院水生所2012生物化学硕士考试专业课试题
中国科学院研究生院水生生物研究所 2012年招收攻读硕士学位研究生入学考试试题 生物化学 一、名词解释(共30分,每小题3分) 1. 超分子复合物 (supermolecular complexe): 2. 多巴胺(dopamine): 3. 旋光活性(optical activity): 4. 两性离子(zwitterions): 5. 加压素(vasopressin): 6. 免疫印迹( ...专业课考研资料 本站小编 免费考研网 2019-03-13中山大学医学院生物化学本科考试试卷
以下内容为生化期末考试复习材料,根据95-08历年考试大题关键词涉及相关知识点频率排序。★数量仅代表出现次数,与重要性无关。 1. 胆汁酸、肝肠循环相关,胆红素代谢 ★★★★★★★★★ 胆汁酸(bile acids):存在于胆汁中一大类胆烷酸总称,以钠盐或钾盐的形式存在,即胆汁酸盐,简称胆盐。有游离型 ...专业课考研资料 本站小编 免费考研网 2019-03-12